核心结论：三方合同到期后，若仅剩下两方有意续约，续约的合法性及具体操作需分情况讨论，具体如下：

1. 原三方合同中有明确约定
   若原合同中明确约定“合同到期后，任意两方达成合意即可续约”，或对续约条件、程序有具体规定，则两方可直接依据合同条款续约。此时需注意：

   • 续约内容（如权利义务、期限、违约责任等）不得超出原合同范围，否则可能被认定为新合同，需重新协商；
     
   • 若原合同涉及需第三方配合的事项（如支付、交付等），续约后两方需自行解决第三方退出后的履行问题，避免因无法履行导致违约。

2. 原三方合同未明确约定续约规则
   若原合同未约定续约条件，两方续约需遵循以下原则：

   • 协商一致原则：两方需就续约的核心条款（如期限、价款、履行方式等）达成合意，并签订书面续约协议，避免口头约定引发纠纷；
     
   • 不损害第三方权益原则：若原合同中第三方的权利义务与两方续约内容相关（如第三方为担保人、受益人等），续约可能需第三方书面同意，否则可能因侵害第三方权益导致续约无效；
     
   • 合法性审查：续约内容不得违反法律、行政法规的强制性规定（如垄断协议、无效条款等），否则续约可能被认定无效。

3. 第三方退出后的特殊情形
   若第三方因合同到期自动退出，但原合同中存在“连带责任”“共同债务”等条款，两方续约时需注意：

   • 若原合同约定第三方退出后，两方仍需对第三方承担连带责任（如共同担保），续约不得免除该责任，否则可能被债权人追责；
     
   • 若原合同约定第三方退出后，两方之间的权利义务需重新分配（如共同投资项目），续约需明确分配规则，避免因权责不清引发纠纷。

实务建议：

• 续约前，两方应共同梳理原合同条款，明确第三方退出后的权利义务变化，避免遗漏关键条款；
  
• 续约协议建议采用书面形式，并由两方签字盖章，必要时可公证或见证，以增强证据效力；
  
• 若续约涉及复杂法律问题（如第三方权益处置、合同效力审查等），可进一步向我咨询，我会结合具体条款和案例为您分析风险点。