关于审理与企业改制相关的民事纠纷案件若干问题的规定是否适用外商投资企业的问题，结论是：该规定原则上主要针对国内企业改制，但部分原则和精神在外商投资企业改制中可参照适用，具体需结合外商投资相关法律法规及政策综合判断。以下从不同角度详细分析：

1. 规定本身的适用范围

• 国内企业改制为主：根据《最高人民法院关于审理与企业改制相关的民事纠纷案件若干问题的规定》（以下简称《规定》），其立法背景和主要目的是解决国内企业改制过程中出现的民事纠纷，如国有资产转让、企业兼并、股份合作制改造等。因此，从字面和立法初衷看，该规定主要针对国内企业。
• 未明确排除外商投资企业：但《规定》中并未明确排除外商投资企业的适用。如果外商投资企业的改制行为与国内企业改制在法律性质上相似（如股权转让、资产剥离等），且不涉及外商投资特有的审批、监管等程序，部分原则和精神可能具有参考价值。

2. 外商投资企业改制的特殊性

• 外资准入与监管：外商投资企业的设立、变更、终止等需遵守《外商投资法》及其实施条例，涉及外资准入负面清单、安全审查、反垄断审查等特殊程序。这些程序是《规定》未涵盖的，需优先适用外商投资相关法律法规。
• 审批与备案要求：外商投资企业改制（如股权变更、合并分立）通常需向商务部门或市场监管部门办理审批或备案手续，而国内企业改制可能无需此类前置程序。因此，外商投资企业改制的程序性要求更高，需单独关注。

3. 司法实践中的参照适用

• 类似案例参考：在司法实践中，若外商投资企业改制纠纷的核心问题（如合同效力、债权债务承担）与国内企业改制无本质差异，法院可能参照《规定》中的原则进行裁判。例如，在股权转让纠纷中，若涉及“名为改制、实为借贷”等情形，法院可能借鉴《规定》中关于合同效力的认定标准。
• 冲突时的处理：若《规定》与外商投资相关法律法规存在冲突（如对同一事项的规定不一致），应优先适用外商投资法律法规。例如，外商投资企业股权转让需经审批生效的，不得以《规定》中“合同成立即生效”的原则否定审批程序的必要性。

4. 实务建议

• 区分改制类型：外商投资企业改制需首先明确是否涉及外资准入、审批等特殊程序。若仅涉及内部股权调整、资产重组等，可参考《规定》中的一般原则；若涉及外资准入或监管，则需严格遵守外商投资法律法规。
• 咨询专业律师：由于外商投资企业改制涉及多部门法交叉（如公司法、合同法、外商投资法），建议企业在改制前咨询专业律师，对改制方案进行合法性审查，避免法律风险。

总结：审理与企业改制相关的民事纠纷案件的规定虽未明确排除外商投资企业，但其适用需结合外商投资相关法律法规及政策综合判断。若您有具体的外商投资企业改制纠纷或需设计改制方案，可直接向我咨询，我将结合您的实际情况提供专业法律意见。