核心结论：在此类货物运输中货物全部烧毁的情况下，赔付主要依据运输合同约定、运输方式所适用的法律法规来确定责任主体与赔偿范围，一般先看合同有无特别约定，无约定时根据不同运输方式按相应规则处理，同时要考虑货物是否有保险等情况。以下是具体分析：

1. 依据运输合同约定
   • 如果运输合同中对货物毁损、灭失的赔偿责任有明确约定，比如约定了特定的赔偿计算方式、赔偿限额等，那么应当首先按照合同的约定来进行赔付。例如，合同中约定在货物全部毁损时，按照货物价值的一定比例进行赔偿，或者约定了一个固定的赔偿金额上限，在这种情况下，就按照这些约定执行。不过，如果合同中的这些约定存在违反法律、行政法规强制性规定等无效情形，那么该约定将不被适用。
2. 无约定时按运输方式适用法规
   • 公路运输：根据《中华人民共和国民法典》第八百三十三条规定，货物的毁损、灭失的赔偿额，当事人有约定的，按照其约定；没有约定或者约定不明确，依据本法第五百一十条的规定仍不能确定的，按照交付或者应当交付时货物到达地的市场价格计算。法律、行政法规对赔偿额的计算方法和赔偿限额另有规定的，依照其规定。所以，在没有合同特别约定时，一般按照货物到达地市场价格计算赔偿额，也就是40万货值对应的金额，但同时要关注是否有法律、行政法规规定的赔偿限额等情况。
   • 铁路运输：依据《中华人民共和国铁路法》第十七条规定，铁路运输企业应当对承运的货物、包裹、行李自接受承运时起到交付时止发生的灭失、短少、变质、污染或者损坏，承担赔偿责任，但有法定免责情形的除外。如果货物全部烧毁，铁路运输企业原则上要承担赔偿责任。赔偿额同样先看合同约定，无约定时，按照实际损失赔偿，但最高不超过国务院铁路主管部门规定的赔偿限额；如果货物是保险运输或者铁路运输企业与托运人、收货人另有约定的，按照约定处理。
   • 航空运输：按照《中华人民共和国民用航空法》规定，旅客、行李或者货物在航空运输中因延误造成的损失，承运人应当承担责任；但是，承运人证明本人或者其受雇人、代理人为了避免损失的发生，已经采取一切必要措施或者不可能采取此种措施的，不承担责任。对于货物全部烧毁这种毁损情况，有约定的从约定，无约定时，在货物运输中造成毁灭、遗失、损坏或者延误的，承运人的赔偿责任限额，为所运货物的重量每公斤30计算单位（1个计算单位相当于数额为150法郎的黄金款项 ）。不过，托运人在交运货物时，声明价值并支付了声明价值附加费的，除承运人证明旅客或者托运人的声明金额高于托运货物或者分列的托运物品在目的地交付时的实际利益外，承运人应当按照声明的金额赔偿。
3. 货物保险情况
   • 如果货物办理了运输保险，在货物全部烧毁属于保险责任范围时，托运人或收货人可以向保险公司提出索赔。保险公司将根据保险合同的约定，对货物的损失进行评估和赔付。一般来说，保险赔付可能会覆盖货物的实际价值，但也可能受到保险金额、免赔额等条款的限制。例如，如果保险金额低于货物实际价值，那么保险公司可能按照保险金额与货物实际价值的比例进行赔付；如果有免赔额规定，那么在赔付时会扣除相应的免赔金额。
4. 免责情形考量
   • 无论是哪种运输方式，承运人如果能够证明货物的毁损、灭失是因不可抗力（如自然灾害、战争等）、货物本身的自然性质或者合理损耗以及托运人、收货人的过错造成的，那么承运人不承担赔偿责任。例如，如果货物烧毁是因为遭遇了罕见的雷击引发火灾，且承运人能够提供相关证据证明其已经尽到了合理的安全运输义务，那么在这种情况下承运人可能无需承担赔偿责任。

在实际处理此类赔付问题时，情况可能会比较复杂，涉及到对各种证据的收集和分析，以确定责任归属和赔偿金额。如果你遇到这种情况，可以进一步向我咨询具体细节，以便更准确地分析和处理。