针对您提出的“超市免费使用不合格塑料袋怎么处罚”的问题，以下是根据《商品零售场所塑料购物袋有偿使用管理办法》及相关法律法规的详细解答：
一、处罚主体
处罚主要由商务主管部门（如县级以上地方人民政府商务主管部门）、价格主管部门、工商行政管理部门以及质量技术监督部门等负责执行。这些部门在各自职责范围内，对超市等商品零售场所的塑料购物袋使用情况进行监督检查。
二、处罚对象
处罚对象主要是向消费者无偿或变相无偿提供塑料购物袋的商品零售场所经营者，包括超市。如果超市使用了不合格的塑料购物袋，并且是无偿提供的，那么超市经营者将面临处罚。
三、具体处罚措施
责令改正：
- 对于首次发现的无偿提供不合格塑料购物袋行为，相关部门会责令超市经营者立即改正，停止无偿提供不合格塑料购物袋。
罚款：
- 如果超市经营者拒不改正或再次违反规定，将面临罚款处罚。罚款金额根据违规情节的严重程度而定，一般处以一定数额的罚款，如1万元以下。
- 对于销售不合格塑料购物袋的行为，工商行政管理部门可以依照相关法律法规进行查处，并可能处以更高的罚款，如违法所得3倍以下，但最高不超过3万元；没有违法所得的，处以1万元以下罚款。
没收违法所得：
- 如果超市通过无偿提供不合格塑料购物袋获取了不正当利益，相关部门将没收其违法所得。
其他行政处罚：
- 在情节严重的情况下，相关部门还可能采取警告、通报批评等其他行政处罚措施。
四、特殊情形下的处罚
- 以低于经营成本销售塑料购物袋：此类行为也被视为违规行为，超市将受到相应的处罚。
- 不标明价格或不按规定明码标价：如果超市未按规定标明塑料购物袋的价格，也将面临处罚。
- 相互串通操纵价格、哄抬价格、价格欺诈等违法行为：这些行为不仅违反了塑料购物袋有偿使用的规定，还触犯了价格法律法规，超市将受到更严厉的处罚。
五、法律依据与监管机制
- 法律依据：《商品零售场所塑料购物袋有偿使用管理办法》是处罚的主要依据，该办法明确规定了商品零售场所不得无偿提供塑料购物袋，并对违规行为设定了相应的处罚措施。
- 监管机制：各级商务、价格、工商和质量技术监督等部门在各自职责范围内对商品零售场所塑料购物袋有偿使用情况进行监督检查，共同维护市场秩序和消费者权益。
综上所述，超市如果免费使用不合格塑料袋，将面临责令改正、罚款、没收违法所得以及其他行政处罚等措施。为了维护市场秩序和消费者权益，超市应严格遵守相关法律法规，使用合格的塑料购物袋，并实行有偿使用制度。