结论前置：

1. 一般情况下，停工留薪期工资不包括加班费。这是基于《工伤保险条例》的规定以及加班费和停工留薪期的性质来理解的。
2. 但具体是否扣除需根据当地法律法规、劳动合同的具体约定以及工伤认定机构的意见来确定。在某些特定情况下，如劳动合同或地方规定有明确要求，加班费可能也会被纳入停工留薪期工资的计算范畴。

详细分析：

法律法规依据

根据《工伤保险条例》第三十三条的规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”是核心争议点，它通常被理解为职工在正常工作、正常出勤情况下所能获得的劳动报酬，主要包括基本工资、岗位工资等相对固定且常规性的收入部分，一般不包括加班费。

加班费与停工留薪期的性质

• 加班费：是劳动者在正常工作时间之外，因额外付出劳动而获得的报酬。它具有不确定性和不规律性，取决于劳动者实际加班的时长和情况。
• 停工留薪期：是专为因工受伤的职工设立的，用于他们接受治疗、恢复健康的特殊时期。在此期间，职工并未实际进行任何加班工作，因此不存在获得加班费的前提。

不同观点与地区差异

• 不支持包含加班费的观点：认为停工留薪期职工并未实际提供额外的加班劳动，将加班费纳入停工留薪期工资发放标准对用人单位而言是不合理的负担，也不符合停工留薪期工资设立的初衷。
• 支持包含加班费的观点：在某些地区或特定情况下，如劳动合同有明确约定或地方规定要求，停工留薪期的工资计算可能会包含加班费，以确保职工在工伤治疗期间能够维持原有的收入水平。不过，这种情况相对较少，且需要具体的法律法规或合同条款作为支撑。

实际操作建议

1. 参考当地法律法规：首先，应了解当地是否有关于停工留薪期工资计算的明确规定。不同地区可能会根据当地的经济状况、社会习惯及司法实践，对“原工资福利待遇”的界定有所微调。
2. 审查劳动合同：同时，应仔细审查劳动合同中的相关条款，看是否有关于停工留薪期工资计算方式的特别约定。如果劳动合同中有明确规定，那么应按照合同约定来执行。
3. 咨询专业意见：如果存在疑问或争议，建议及时向我咨询，以获取准确的法律意见和指导。我会根据具体情况，结合相关法律法规和司法实践，为你提供专业的解答和建议。

总结与提醒：

停工留薪期工资的计算是一个复杂且具体的问题，需要根据实际情况进行综合考虑和判断。在处理此类问题时，建议遵循法律法规、劳动合同约定以及工伤认定机构的意见，确保职工的合法权益得到妥善保障。如果你有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。