农业行政执法中，一般应先立案再调查，但在特定紧急情况下可先调查后补立案手续。具体分析如下：
- 一般程序要求：先立案后调查
根据《农业行政处罚程序规定》第三十条，农业行政处罚机关对涉嫌违反农业法律、法规和规章的行为，应当进行初步审查。符合下列条件的，应当在七个工作日内予以立案：
- 有涉嫌违反农业法律、法规和规章的行为；
- 依法应当或者可以给予行政处罚；
- 属于本机关管辖；
- 违法行为发生之日起至被发现之日止未超过二年，或者法律、法规另有规定；
- 违法行为涉嫌犯罪的，应当及时移送司法机关。
立案是行政处罚程序的法定起点，立案后执法机关方可开展调查取证工作。这一程序要求旨在确保行政执法的合法性和规范性，防止执法机关滥用职权。
- 紧急情况下的例外：先调查后补立案
在特定紧急情况下，如证据可能灭失、违法行为可能继续扩大等，执法机关可以先行调查取证，并在调查结束后及时补办立案手续。这种例外情形通常适用于以下情况：
- 违法行为正在实施，且可能对农业生产、农产品质量安全等造成严重危害；
- 证据可能因自然原因、人为因素等灭失或难以取得；
- 当事人可能逃避执法或销毁证据。
在此类情况下，执法机关应当制作现场检查笔录、询问笔录等证据材料，并在调查结束后尽快补办立案手续，以确保行政执法的合法性和有效性。
- 实务建议
- 严格遵守法定程序：农业行政执法机关应当严格按照法定程序开展执法活动，确保立案、调查、审查、决定等各个环节的合法性和规范性。
- 完善证据收集：在调查过程中，执法机关应当注重证据的收集和保存，确保证据的合法性、真实性和关联性。
- 及时补办立案手续：在紧急情况下先行调查的，执法机关应当在调查结束后及时补办立案手续，避免因程序瑕疵导致行政处罚无效。
- 加强执法监督：农业行政执法机关应当建立健全执法监督机制，对执法活动进行全程监督，确保执法行为的合法性和公正性。