针对甲方耕地在不知情的情况下被乙方种树的问题，以下是从不同角度给出的分析和建议：

1. 土地权益保护角度：

   • 土地使用权归属：首先，需要明确的是，耕地的使用权归甲方所有。乙方在未经甲方同意的情况下，在甲方的耕地上种树，这侵犯了甲方的土地使用权。
   • 法律后果：根据《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规，乙方可能面临责令退还土地、恢复土地原状、罚款等行政处罚。如果乙方的行为给甲方造成了经济损失，甲方还有权要求乙方进行赔偿。

2. 协商解决角度：

   • 沟通协商：在发现乙方种树后，甲方可以首先尝试与乙方进行沟通协商，了解乙方种树的原因和意图，并表达自己的立场和诉求。
   • 达成协议：如果双方能够达成一致意见，可以签订书面协议，明确双方的权利和义务，包括乙方移除树木、恢复土地原状的时间节点，以及可能涉及的赔偿问题等。

3. 法律途径解决角度：

   • 发送律师函：如果协商无果，甲方可以寻求律师帮助，由律师根据事实、证据及相关法律规定，向乙方发出律师函，明确告知乙方其行为的违法性，并要求乙方立即停止侵权行为，移除树木，恢复土地原状。
   • 提起诉讼：如果乙方仍然拒绝履行义务，甲方可以向人民法院提起民事诉讼，要求乙方承担侵权责任，包括移除树木、恢复土地原状、赔偿经济损失等。在诉讼过程中，甲方需要提供充分的证据来证明自己的土地使用权以及乙方的侵权行为。

4. 预防措施角度：

   • 加强土地管理：为了避免类似情况再次发生，甲方可以加强对自己耕地的管理，设置明显的界限标志，定期巡查，及时发现并制止任何未经允许的侵占或使用行为。
   • 签订土地使用协议：如果甲方愿意将土地出租或出借给乙方使用，应当签订书面协议，明确双方的权利和义务，包括土地的使用范围、使用期限、使用方式以及违约责任等。

在处理此类问题时，甲方需要注意以下几点：

• 保留证据：甲方需要保留好与土地使用权相关的证据，如土地承包合同、土地使用权证等，以及乙方种树的证据，如照片、视频等。
• 及时行动：一旦发现乙方种树，甲方应当及时采取行动，避免损失扩大。
• 合法维权：在维权过程中，甲方应当遵守法律法规，通过合法途径解决问题，避免采取过激行为或违法手段。

如果甲方在处理此类问题时遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。