关于档案中未记载有害工种导致退休金经济损失的赔偿年限问题，需分情况讨论，核心结论如下：

1. 若能通过其他证据证明有害工种经历，可主张补发退休金差额，赔偿年限从应享受特殊工种待遇之日起计算
   根据《劳动和社会保障部关于制止和纠正违反国家规定办理企业职工提前退休有关问题的通知》（劳社部发〔1999〕8号），特殊工种退休需满足“档案明确记载”或“原始工资表、考勤记录等佐证”的条件。若档案未记载但能提供其他证据（如工作证、工友证言、单位安全记录等），可向社保部门申请重新认定工种，补发退休金差额。赔偿年限从达到法定退休年龄且应享受特殊工种待遇之日起算，至实际补发之日止。

2. 若无法证明有害工种经历，原则上无法主张赔偿，但可尝试通过行政诉讼或民事诉讼争取权益
   若完全无法提供证据（如单位未留存任何记录、工友不愿作证等），社保部门可能拒绝补发退休金。此时可尝试：

   • 行政诉讼：以社保部门“不履行法定职责”为由起诉，要求重新认定工种。若法院支持，赔偿年限从起诉之日起算（但需注意行政诉讼时效为6个月，自知道或应当知道行政行为之日起计算）。
     
   • 民事诉讼：以单位“未如实记录工种”为由起诉，要求赔偿经济损失。但需证明单位存在过错（如故意隐瞒、未履行档案保管义务等），赔偿年限从退休之日起算，最长不超过20年（根据《民法典》第188条诉讼时效规定）。

3. 特殊情况：若单位未缴纳社保导致退休金损失，赔偿年限为未缴费年限
   若档案未记载有害工种是因单位未缴纳社保（如未将特殊工种岗位纳入社保缴费范围），则可主张单位赔偿退休金损失。赔偿年限为未缴费年限（如工作10年未缴费，则赔偿10年退休金差额），计算公式为：
   $\( \text{赔偿金额} = \text{应发退休金} - \text{实际发放退休金} \times \text{未缴费年限} \)$
   （应发退休金按特殊工种标准计算，实际发放按普通工种标准计算）

法律建议：

• 优先收集证据（如工作证、工友证言、单位安全记录等），向社保部门申请重新认定工种；
  
• 若社保部门拒绝，可咨询律师提起行政诉讼或民事诉讼；
  
• 注意诉讼时效（行政诉讼6个月，民事诉讼3年），避免超期。
  

示例：
张某从事有毒有害工种15年，但档案未记载。退休后发现普通工种退休金比特殊工种少800元/月。若能提供工友证言和单位安全记录，可主张补发15年退休金差额（共14.4万元）；若无法提供证据，但能证明单位未缴纳社保，则可主张赔偿15年差额（需以单位过错为前提）。

如有进一步证据或细节，可向我咨询具体方案。