结论：公司恶意扣除员工绩效，员工有权通过劳动仲裁要求公司补回绩效，并可能获得相应的补偿。
法律背景与依据：
劳动合同与工资支付：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。绩效工资作为劳动报酬的一部分，同样受到法律保护。
- 若公司无正当理由恶意扣除员工绩效，即构成对劳动合同的违反，员工有权要求公司补回被扣除的绩效。
劳动仲裁的适用：
- 劳动仲裁是解决劳动争议的一种有效方式。当员工与公司之间因工资支付等问题发生争议时，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 仲裁委员会将依法审理案件，并根据事实和法律作出裁决。若裁决支持员工的请求，公司需履行裁决义务，补回被扣除的绩效，并可能需支付额外的补偿（如经济补偿金、赔偿金等，具体根据案件情况和法律规定确定）。
法律建议与行动步骤：
收集证据：
- 员工应首先收集与公司恶意扣除绩效相关的证据，如工资条、绩效评估表、公司通知或公告、与上级或人力资源部门的沟通记录等。
- 这些证据将有助于证明公司存在恶意扣除绩效的行为，以及员工因此遭受的损失。
与公司协商：
- 在收集到足够证据后，员工可以尝试与公司进行协商，要求公司补回被扣除的绩效，并可能要求公司支付额外的补偿。
- 协商过程中，员工应保持冷静和理性，明确表达自己的诉求和依据，并尝试与公司达成和解协议。
申请劳动仲裁：
- 若协商无果，员工可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 申请仲裁时，员工需提交仲裁申请书、相关证据材料以及身份证明等文件。
- 仲裁委员会将依法受理案件，并安排开庭审理。员工应按时参加庭审，并积极配合仲裁委员会的工作。
执行仲裁裁决：
- 若仲裁委员会裁决支持员工的请求，公司需履行裁决义务。
- 若公司拒不履行裁决义务，员工可以向人民法院申请强制执行。
可能法律后果：
- 若公司被认定存在恶意扣除员工绩效的行为，除了需补回被扣除的绩效外，还可能需支付额外的补偿（如经济补偿金、赔偿金等）。
- 公司的违法行为还可能受到劳动行政部门的处罚，如罚款、责令改正等。
进一步思考：
- 员工在维护自己权益的同时，也应考虑与公司保持良好关系的重要性。在申请仲裁前，尝试通过协商解决问题可能更为高效和和谐。
- 若员工对劳动仲裁结果不满意，还可以在法定期限内向人民法院提起诉讼，寻求更进一步的法律救济。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。