结论：公司以经营困难为由给员工长期放假并支付最低工资，在符合特定条件下是合法的，但也可能存在违法情况。具体是否合法，需结合放假原因、程序是否合法合规以及劳动合同中的相关约定来综合判断。
详细分析：
放假原因与程序合法性：
- 正当理由：若公司确实因经营困难（如市场需求下降、资金链断裂等）需要暂停生产经营活动，且这一决定经过了与员工的充分沟通、协商，并履行了必要的法定程序（如向劳动行政部门报备），那么安排员工放假并支付最低工资是合法的。
- 恶意规避：若公司无正当理由，或以经营困难为借口恶意给员工放假，以规避劳动义务（如减少工资支出、逃避社保缴纳等），则违反了劳动法律法规，损害了员工权益，这种行为是不合法的。
最低工资标准：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十八条，用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。因此，若公司在放假期间支付的工资不低于此标准，从这一角度看是合法的。但需注意，最低工资标准旨在保障劳动者的基本生活需求，公司不能仅以此标准作为长期放假期间的唯一工资支付方式，而应考虑员工的实际生活需要和公司的经济状况，合理确定工资支付水平。
劳动合同约定：
- 若劳动合同中有关于放假期间工资支付的特别约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，公司应按照约定执行。若劳动合同中未明确约定，则公司应依据相关法律法规和公司规章制度来确定工资支付方式。
公平公正原则：
- 如果公司仅针对个别员工进行长时间放假并支付最低工资，而其他员工正常工作且无合理解释，可能构成对特定员工的不公平待遇，违反了劳动法中的公平公正原则。在这种情况下，员工有权向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
员工权益保障建议：
- 了解自身权益：员工应了解自己的合法权益，包括工资支付标准、放假期间的权益保障等。若发现公司行为违法或侵害了自己的权益，应及时采取措施进行维权。
- 与公司沟通协商：员工可以尝试与公司进行沟通协商，了解放假及工资支付的具体原因和安排，争取通过协商解决争议。在协商过程中，员工可以提出自己的合理诉求和建议，以寻求双方都能接受的解决方案。
- 申请劳动仲裁或诉讼：若协商无果且公司行为确实违法，员工可依法申请劳动仲裁或提起诉讼以维护自身合法权益。在申请劳动仲裁或提起诉讼前，员工应收集好相关证据材料，如劳动合同、工资单、放假通知等，以支持自己的诉求。
公司注意事项与建议：
- 合法合规操作：公司在决定放假并支付最低工资前，应确保这一行为符合相关法律法规的规定和劳动合同的约定。公司应咨询专业法律顾问或律师，以确保自己的行为合法合规。
- 充分沟通协商：公司应与员工进行充分沟通协商，明确放假原因、工作安排、薪酬支付标准等事项。通过沟通协商，可以增进双方的理解和信任，减少劳动争议的发生。
- 人性化管理：在处理员工放假事宜时，公司应秉持人性化管理原则，考虑员工的实际情况和需求。公司可以提供必要的帮助和支持，如提供职业培训、介绍其他工作机会等，以帮助员工度过难关。
综上所述，公司以经营困难为由给员工长期放假并支付最低工资的合法性需根据具体情况综合判断。在合法合规的前提下，公司应充分保障员工权益，避免产生不必要的劳动争议。员工也应了解自己的合法权益并在必要时采取合法手段进行维权。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。