当企业查出员工有犯罪记录时，这是一个需要谨慎处理的问题，既要考虑企业的用工安全和合规性，也要尊重和保护员工的合法权益。以下是我为您提供的详细解答：
一、确认查询的合法性与合规性
首先，企业需要确认查询员工犯罪记录的过程是否合法且合规。这包括：
获得员工授权：在查询前，企业必须获得员工明确的书面授权同意，这是查询行为合法性的重要前提。授权书应清晰说明查询目的、范围、期限等关键信息，并由员工签字确认。
选择合法查询途径：企业应通过正规渠道进行查询，如委托有资质的第三方背景调查机构，或向员工户籍所在地的公安机关提出查询申请。在查询过程中，企业需严格遵守相关法律法规，确保查询行为的正当性。
二、理性分析查询结果
当企业获得员工的犯罪记录后，应理性分析并根据实际情况做出合理决策：
评估犯罪记录与岗位的相关性：企业应评估员工的犯罪记录是否与其将从事的岗位直接相关。例如，对于涉及财务、安全等敏感岗位的员工，其犯罪记录可能更为重要。
考虑犯罪的性质、时间和严重程度：企业应考虑员工犯罪的性质、发生时间以及严重程度。对于轻微犯罪或已过去较长时间的犯罪，企业可能不需要过于严格地对待。
尊重员工的申诉权利：如果员工对查询结果有异议，企业应给予其解释和辩护的机会，确保决策的公正性。
三、采取合理措施
根据查询结果和理性分析，企业可以采取以下合理措施：
调整岗位或工作内容：如果员工的犯罪记录与其当前岗位不兼容，企业可以考虑调整其岗位或工作内容，以降低潜在风险。
加强培训与监督：对于有犯罪记录的员工，企业可以加强相关培训，提高其法律意识和职业道德水平，并加强对其工作行为的监督。
依法解除劳动合同：在极端情况下，如果员工的犯罪记录严重违反了企业的规章制度或法律法规，企业可以依法解除与其的劳动合同。但在此过程中，企业需确保解除合同的合法性和合规性，避免引发法律纠纷。
四、保护员工隐私与合法权益
在整个处理过程中，企业必须严格保护员工的隐私权和合法权益：
保密查询结果：企业应建立完善的保密机制，确保查询结果的安全性和保密性。查询结果只能用于合法的、与工作相关的目的，不得泄露或滥用。
避免歧视与偏见：企业应避免对有犯罪记录的员工产生歧视或偏见，确保其在企业内享有平等的权利和机会。
提供必要的支持与帮助：如果员工因犯罪记录而面临困难或挑战，企业可以提供必要的支持与帮助，如心理咨询、职业培训等，以促进其重新融入社会和企业。
综上所述，当企业查出员工有犯罪记录时，应理性分析、采取合理措施，并严格保护员工的隐私权和合法权益。通过合法、正当且必要的程序处理这一问题，企业可以确保用工安全的同时，也维护了员工的尊严和权益。