结论：在协议约定被告住所地管辖，但被告被判刑在其他地方服刑的情况下，案件的管辖法院需根据具体情况来确定，一般可能由被告服刑地法院或原被告住所地法院管辖，具体取决于案件类型和实际情况。

分析说明：

1. 一般原则：

   • 在民事诉讼中，如果协议中明确约定了由被告住所地法院管辖，那么原则上应当遵循该约定。然而，当被告因刑事犯罪被判刑并在其他地方服刑时，其原住所地可能已不再是实际居住地，这给管辖法院的确定带来了一定的复杂性。

2. 被告服刑地法院管辖的可能性：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，对于被监禁的人提起的诉讼，如果被告被监禁或被采取强制性教育措施一年以上的，由被告被监禁地或者被采取强制性教育措施地人民法院管辖。这意味着，在被告被长期监禁的情况下，其服刑地法院可能成为管辖法院。

3. 原被告住所地法院管辖的考量：

   • 如果被告被监禁的时间较短，或者案件性质、实际情况使得由被告服刑地法院管辖不太合适，那么也可以考虑由被告原住所地或者原告住所地法院管辖。特别是当协议管辖的条款仍然有效，且没有其他法律条款或特殊情况排除其适用时，原被告住所地法院仍有可能是管辖法院。不过，若被告服刑地与原住所地相隔甚远，从便利诉讼和节约司法资源的角度出发，服刑地法院管辖可能更为合理。

4. 特殊情况下的管辖确定：

   • 在某些特殊情况下，如案件涉及国家利益、社会公共利益或当事人人数众多等，可能需要由更高级别的法院或指定法院管辖。此外，如果双方当事人在协议管辖条款中未明确排除其他管辖法院，或者存在其他影响管辖法院确定的法律因素，也需要综合考虑这些因素来确定最终的管辖法院。

行动建议：

• 查阅具体协议：首先，应仔细查阅双方签订的协议，确认管辖条款的具体内容，包括是否明确排除了其他管辖法院、是否对被告服刑等特殊情况有特别约定等。
• 咨询专业律师：由于管辖法院的确定涉及复杂的法律问题和实际情况考量，建议咨询专业律师以获取更具体、更准确的法律意见。
• 准备相关证据：在提起诉讼或应对诉讼时，应准备相关证据以支持自己的管辖主张，如协议文本、被告服刑证明、双方当事人的身份信息等。

后续思考依据：

• 在确定管辖法院时，应充分考虑案件的性质、实际情况以及双方当事人的利益平衡。
• 如果对管辖法院的确定存在争议或不确定，应及时寻求法律帮助以避免因管辖问题而延误诉讼进程或造成不必要的损失。