一案中出现两个鉴定机构，即“一案双委托”的情形，其合法性需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
合法情形
当事人协商一致并经法院或仲裁机构同意：
- 在诉讼或仲裁过程中，如果双方当事人对鉴定事项存在争议，且均同意委托两个或两个以上的鉴定机构进行鉴定，同时这一做法也得到了法院或仲裁机构的批准，那么这种“一案双委托”是合法的。
- 例如，在一起复杂的医疗纠纷案件中，原告和被告可能分别委托了不同的医学鉴定机构对医疗行为进行鉴定，以更全面地了解案件事实。如果双方协商一致，并且法院也认为这种做法有助于查明事实，那么这种“一案双委托”就是合法的。
法律、行政法规或司法解释有特别规定：
- 在某些特定类型的案件中，法律、行政法规或司法解释可能明确规定需要委托两个或两个以上的鉴定机构进行鉴定。
- 例如，在环境污染案件中，可能需要同时委托环境监测机构和损害评估机构进行鉴定，以分别确定污染程度和损害后果。这种情况下，“一案双委托”是合法的，并且是必要的。
非法情形
未经当事人协商一致或未经法院、仲裁机构同意：
- 如果一方当事人未经另一方当事人同意，擅自委托两个或两个以上的鉴定机构进行鉴定，或者虽然双方当事人协商一致，但未经法院或仲裁机构批准，那么这种“一案双委托”可能是非法的。
- 例如，在一起合同纠纷案件中，一方当事人可能为了获取更有利的鉴定结果，擅自委托了两个鉴定机构进行鉴定。这种做法可能违反了诉讼或仲裁程序的规定，因此是非法的。
鉴定机构之间存在利益冲突或影响鉴定公正性：
- 如果两个或两个以上的鉴定机构之间存在利益关系，或者它们的鉴定结果可能相互影响，导致鉴定公正性受到质疑，那么这种“一案双委托”也是非法的。
- 例如，如果两个鉴定机构属于同一集团或存在其他利益关系，那么它们对同一案件的鉴定结果可能存在倾向性，从而损害了当事人的合法权益。
法律建议
- 在诉讼或仲裁过程中，如果当事人认为需要委托两个或两个以上的鉴定机构进行鉴定，应当首先与对方当事人协商一致，并征得法院或仲裁机构的批准。
- 在选择鉴定机构时，应当确保鉴定机构具有相应的资质和独立性，避免选择存在利益关系或可能影响鉴定公正性的鉴定机构。
- 如果发现“一案双委托”存在非法情形，当事人可以向法院或仲裁机构提出异议，并要求重新选择鉴定机构或进行其他补救措施。
一案中出现两个鉴定机构是否合法，取决于具体情况和法律规定。如果您在合同纠纷中遇到了类似问题，或者对“一案双委托”的合法性有疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。