股份合作协议没有去变更营业执照，该协议本身在股东之间仍然是有效的，但可能面临对外公示效力受限及行政处罚的风险。以下从不同角度为您详细分析：

一、协议在股东之间的效力

1. 合同相对性原则：股份合作协议是股东之间就股权分配、公司治理等事项达成的合意，根据合同相对性原则，该协议在股东之间具有法律约束力。即使未办理营业执照变更登记，也不影响协议在股东之间的效力。
2. 内部效力不受影响：营业执照变更登记主要是对外公示公司股东结构的变化，而股份合作协议作为股东之间的内部约定，其效力并不依赖于营业执照的变更。因此，即使未变更营业执照，股东之间仍应按照协议约定履行各自义务。

二、对外公示效力受限

1. 第三人信赖保护：营业执照是公司对外公示其股东结构、注册资本等重要信息的主要方式。如果股份合作协议签订后未办理营业执照变更登记，第三人可能无法及时了解到公司股东结构的变化，从而基于原有营业执照信息与公司进行交易。在这种情况下，如果因股东结构变化导致公司履约能力下降，第三人可能主张信赖保护，要求原股东承担责任。
2. 交易安全风险：未变更营业执照可能导致公司在对外交易时面临一定的法律风险。例如，在签订合同时，对方可能要求公司提供最新的营业执照以确认公司股东结构。如果公司无法提供，可能导致合同无法签订或履行过程中产生纠纷。

三、行政处罚风险

1. 违反公司登记管理规定：根据《中华人民共和国公司登记管理条例》等相关法律法规的规定，公司股东结构发生变化时，应及时办理营业执照变更登记。如果未按时办理变更登记，公司可能面临工商行政管理部门的行政处罚，如罚款、责令限期改正等。
2. 影响公司信誉：未按时办理营业执照变更登记还可能影响公司的信誉和形象，对公司的长期发展产生不利影响。

四、建议与措施

1. 及时办理变更登记：为了避免上述风险，建议在签订股份合作协议后尽快办理营业执照变更登记手续。这不仅可以确保协议的对外公示效力，还可以避免行政处罚风险。
2. 完善内部治理机制：在办理营业执照变更登记的同时，还应完善公司内部治理机制，如修订公司章程、明确股东权利义务等，以确保公司运营的规范性和稳定性。
3. 咨询专业律师：在办理营业执照变更登记过程中，如果遇到任何法律问题或困惑，建议及时咨询专业律师以获取专业指导和帮助。

总结来说，股份合作协议没有去变更营业执照并不影响其在股东之间的效力，但可能面临对外公示效力受限及行政处罚的风险。因此，建议尽快办理营业执照变更登记手续以确保公司运营的合规性和稳定性。如果您在办理过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。