当公司更换劳动合同，且之前签订的时间与现签订的有冲突时，在现有合同中应明确注明以下几点，以避免潜在的法律风险和纠纷：
合同变更的说明：
- 在新合同中，应明确指出这是对原合同的变更或补充，并详细说明变更的原因和背景，比如是因为公司政策调整、岗位变动还是其他原因导致的合同变更。
- 注明原合同的签订日期、合同编号（如有）以及变更的具体条款或内容，确保双方对变更的部分有清晰的认识。
时间冲突的解决：
- 针对时间冲突的问题，应在新合同中明确说明新合同的生效日期，以及它与原合同的关系。例如，可以规定“本合同自XXXX年XX月XX日起生效，自生效之日起，原合同中与本合同相冲突的部分自动失效”。
- 如果新合同是对原合同的延续或部分修改，也应明确说明哪些条款继续有效，哪些条款被修改或废止。
双方的权利与义务：
- 在新合同中，应详细列明双方的权利与义务，特别是与变更部分相关的权利与义务，确保双方对各自的责任有清晰的认识。
- 包括但不限于工作内容、工作地点、工作时间、薪资待遇、福利待遇、保密义务、竞业限制等关键条款。
违约责任与争议解决：
- 明确双方违反合同约定时应承担的责任，以及争议解决的方式和途径。这有助于在发生纠纷时，双方能够迅速、有效地解决问题。
- 可以约定仲裁或诉讼等争议解决方式，并明确仲裁机构或诉讼法院的选择。
其他必要条款：
- 根据实际情况，还可以在新合同中加入其他必要的条款，如合同的解除条件、终止条件、通知与送达方式等。
- 确保这些条款符合法律法规的规定，并能够保护双方的合法权益。
法律背景与建议：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同的变更应当遵循平等自愿、协商一致的原则，并采用书面形式。因此，在更换劳动合同时，务必确保双方已经就变更的内容进行了充分的协商，并达成了书面协议。
- 在签订新合同前，建议双方对原合同进行仔细的审查，确保新合同中的条款与原合同不冲突，或者已经对冲突的部分进行了明确的说明和修改。
- 如果双方在合同变更过程中存在分歧或争议，建议及时寻求法律援助或咨询专业律师，以避免潜在的法律风险。
可能后果：
- 如果未在新合同中明确注明合同变更的说明、时间冲突的解决方式等关键信息，可能会导致双方在合同履行过程中产生争议和纠纷。
- 在争议发生时，如果双方无法就变更的内容达成一致意见，可能会需要通过法律途径解决争议，这将会耗费双方的时间和精力，并可能带来不必要的经济损失。
因此，在更换劳动合同时，务必确保新合同中的条款清晰、明确，并符合法律法规的规定。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。