在小区内建立垃圾中转站是否合法，需视具体情况而定，但必须严格遵守相关法律法规和程序。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、规划与审批角度
城乡规划法：垃圾中转站的建设必须符合城市总体规划、详细规划等要求。建设单位需向城乡规划主管部门申请办理建设工程规划许可证，未取得规划许可的建设行为将被视为违法，可能面临限期拆除、罚款等处罚。因此，若小区内建设垃圾中转站未经过规划审批，则属于违法行为。
环境影响评价：垃圾中转站作为可能对环境产生影响的建设项目，需进行环境影响评价，并编制相应的环境影响报告书、报告表或登记表，经环保部门审批通过后方可开工建设。这包括对空气、水质、土壤等环境要素的全面评估及制定环境保护措施。若未进行环境影响评价或未通过审批，则建设行为同样违法。
二、土地使用权与建筑许可角度
土地使用权：建立垃圾中转站需确保已取得合法的土地使用权，这可能涉及土地出让、租赁或划拨等方式。若未取得合法土地使用权而擅自建设，则属于违法行为。
建筑法及相关规定：在开始建设前，需向建设行政主管部门申请建筑许可证，并按照批准的图纸和规范进行施工。施工完成后，还需通过相关部门的验收，确保建筑质量和安全符合国家标准。若未取得建筑许可证或未通过验收而擅自使用，则同样违法。
三、环保与运营管理角度
环保法规：垃圾中转站的建设和运营必须遵守环境保护原则，采取有效措施防治废气、废水、废渣、噪声等污染。例如，安装除臭设备、采取覆盖和密闭运输措施减少扬尘和异味排放，选用低噪声设备并设置隔音屏障等。若未采取有效措施防治污染或污染物排放超标，则可能面临环保部门的处罚。
城市生活垃圾管理办法：垃圾中转站作为城市生活垃圾收集、转运的重要设施，其建设和运营应符合相关技术标准和规范。运营单位需建立健全垃圾收集、运输管理制度，确保垃圾及时、安全地转运至处理场所。若运营单位未履行相关管理职责或造成环境污染等后果，则需承担相应的法律责任。
四、物权与相邻关系角度
建筑物区分所有权：若垃圾中转站建设涉及占用小区公共区域，需经过业主共同决定，满足专有部分面积占比三分之二以上且人数占比三分之二以上的业主参与表决，并经参与表决专有部分面积四分之三以上且参与表决人数四分之三以上的业主同意。若未经业主同意而擅自占用公共区域建设垃圾中转站，则可能侵犯业主的合法权益。
相邻关系：垃圾中转站的建设和运营不得损害相邻业主的合法权益，如通风、采光、通行等权利。若造成妨碍或损失，应承担排除妨碍、赔偿损失等民事责任。因此，在建设垃圾中转站时，应充分考虑对周边环境的影响，并采取有效措施减少对相邻业主的干扰和损害。
五、特殊规定与政策角度
某些地区或城市可能针对垃圾中转站有特殊规定或政策，例如对垃圾中转站的选址、建设规模、运营时间等方面有具体要求。因此，在具体操作时还需参考当地的相关法规和政策文件，确保项目的全面合规。
总结与建议：
小区内建立垃圾中转站是一个复杂且涉及多个法律领域的过程。为确保项目的合法性和合规性，同时最小化对环境和居民权益的影响，建议建设单位和运营单位在以下几个方面加以注意：
若您对小区内建设垃圾中转站的具体情况有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。