在劳动仲裁中，公司盖章的文件通常是有效的，但具体效力需结合文件内容、盖章行为及法律规定综合判断。以下从不同角度详细分析：

1. 盖章行为的法律效力基础

• 公章的代表权：根据《民法典》及相关司法解释，公司公章是法人权利的象征，在法律上代表公司意志。加盖公章的文件，原则上视为公司对文件内容的认可，具有法律效力。
• 例外情形：若盖章行为存在无权代理（如非法定代表人或授权人员盖章）、超越权限（如盖章内容超出公司授权范围）或违反法律强制性规定（如伪造公章），则文件可能无效。

2. 劳动仲裁中公司盖章文件的常见类型及效力

• 劳动合同：若劳动合同加盖公司公章，且内容合法，通常视为双方真实意思表示，具有法律效力。仲裁中可作为证明劳动关系、工资标准等的关键证据。
• 工资条、考勤记录：公司盖章的工资条、考勤记录等，可直接证明工资发放情况、出勤情况，仲裁中一般被采信。
• 解除劳动合同通知：公司盖章的解除通知，若符合法定程序（如提前通知、支付经济补偿等），通常有效；若程序违法（如未提前通知、未支付补偿），则可能被认定为违法解除。
• 其他文件：如培训协议、保密协议等，加盖公章后同样具有法律效力，但需结合具体内容判断是否合法有效。

3. 盖章文件在仲裁中的举证责任

• 劳动者主张权利：若劳动者持公司盖章文件主张权利（如工资、加班费等），公司需提供反证证明文件无效（如证明盖章行为违法、内容不真实等），否则仲裁机构一般采信劳动者证据。
• 公司抗辩：若公司主张文件无效（如伪造公章、非公司真实意思表示），需承担举证责任，提供证据证明盖章行为违法或内容不真实。

4. 实务建议

• 劳动者：
  1. 妥善保管公司盖章文件，作为仲裁证据；
  2. 若对文件效力有疑问（如怀疑伪造公章），可申请司法鉴定；
  3. 仲裁中积极举证，证明文件内容真实、合法。
• 公司：
  1. 规范公章管理，避免无权人员盖章；
  2. 对盖章文件内容严格审核，确保合法合规；
  3. 若发现伪造公章行为，及时报警并保留证据。

5. 特殊情形：未盖章但有效的文件

• 法定代表人签字：若文件由公司法定代表人签字，即使未盖章，通常也视为公司行为，具有法律效力。
• 表见代理：若劳动者有理由相信盖章人员有权代表公司（如长期代表公司签字），即使实际无权，文件也可能被认定为有效（表见代理）。

总结：公司盖章的文件在劳动仲裁中通常有效，但需结合文件内容、盖章行为及法律规定综合判断。若对文件效力有争议，建议及时咨询专业律师，通过法律途径解决。