厂房无证出租导致合同无效时，赔偿问题需根据过错责任、实际损失及合同约定综合判定，具体处理方式如下：

1. 合同无效的法律依据与过错划分
   根据《民法典》第157条，合同无效后，因该合同取得的财产应返还，不能返还或无必要返还的应折价补偿；有过错的一方需赔偿对方损失，双方均有过错的则按过错比例分担。

   • 出租方责任：若厂房无证系因出租方未办理产权证、规划许可等手续，或明知无法办理仍出租，通常承担主要过错责任。
     
   • 承租方责任：若承租方未尽合理审查义务（如未核查产权证、规划许可），或明知无证仍签订合同，可能承担次要责任。
     

2. 赔偿范围与计算方式

   • 实际损失赔偿：
     
     • 装修费用：若装修已形成附合（如固定在厂房内的设备、装修），出租方需按过错比例补偿残值损失。
       
     • 搬迁费用：因合同无效导致的搬迁、临时安置等费用，由过错方按比例承担。
       
     • 经营损失：若承租方能证明因合同无效导致停业、利润减少等直接损失，可要求赔偿，但需举证损失与合同无效的因果关系。
       
   • 租金处理：
     
     • 已支付的租金应返还，但承租方需按实际使用期限支付房屋占有使用费（通常参照租金标准）。
       
     • 若出租方明知无证仍出租，可能被认定恶意，需全额返还租金；若承租方明知无证仍承租，可能被要求支付部分使用费。
       

3. 特殊情形下的赔偿规则

   • 违法建筑出租：若厂房系违法建筑（如未取得建设工程规划许可证），合同自始无效，双方均不得主张租金或使用费，仅能要求返还财产或赔偿实际损失。
     
   • 政府责令拆除：若厂房因无证被政府强制拆除，承租方无法继续使用，出租方需赔偿装修残值、搬迁费用等，但承租方需自行承担经营风险。
     

4. 实务建议

   • 证据固定：保存合同、付款凭证、装修发票、沟通记录等，以证明损失范围及过错程度。
     
   • 协商优先：双方可协商赔偿比例，避免诉讼成本。
     
   • 诉讼策略：若协商不成，承租方可起诉要求返还租金、赔偿损失；出租方可反诉要求支付使用费或赔偿房屋损耗。
     

提示：具体赔偿金额需结合案件细节（如无证原因、双方过错程度、实际损失等）判定，建议提供合同、产权证明等材料进一步分析。如有疑问，可直接向我咨询厂房租赁纠纷相关问题。