结论：父亲被判处五年以上刑罚，一般情况下不会直接影响儿子担任书记的资格，但具体需结合书记的任职单位性质及政审要求综合判断。以下分情况详细说明：

1. 若书记岗位属于公务员或事业单位编制（如村党支部书记、国企党委书记等）

• 政审环节可能受影响：根据《公务员法》《公安机关录用人民警察政治考察工作办法》等规定，公务员及事业单位招聘需进行政治审查，考察范围包括考生本人及直系亲属（父母、配偶、子女等）的犯罪记录。若父亲因故意犯罪被判处五年以上刑罚，可能被认定为“直系亲属有危害国家安全犯罪或严重刑事犯罪记录”，导致儿子政审不通过。
• 例外情形：若父亲犯罪属于过失犯罪（如交通肇事罪），或儿子报考的岗位对政审要求相对宽松（如部分基层岗位），可能仍有机会通过政审。但需以具体单位政审标准为准。

2. 若书记岗位属于企业或社会组织（如民营企业党支部书记、行业协会负责人等）

• 通常不受影响：企业或社会组织的任职一般不涉及政审，仅需符合《公司法》《社会组织登记管理条例》等规定的任职资格（如无经济犯罪记录、具备完全民事行为能力等）。父亲犯罪记录与儿子任职无直接关联。
• 特殊情形：若企业或组织内部有额外规定（如要求员工直系亲属无犯罪记录），则可能受限，但此类规定需符合法律法规，不得歧视性设置条件。

3. 若书记岗位涉及国家安全或特殊行业（如军工企业党委书记、涉密单位负责人等）

• 政审要求极为严格：此类岗位通常需通过“安全审查”，不仅考察本人，还会深入调查直系亲属的犯罪记录、政治立场等。父亲被判处五年以上刑罚（尤其是危害国家安全类犯罪）几乎必然导致儿子无法通过审查。

行动建议

1. 确认岗位性质：首先明确“书记”的具体任职单位（如政府机关、国企、村集体、民营企业等），不同单位政审标准差异较大。
2. 咨询招聘单位：直接向目标单位人事部门或上级主管部门了解政审具体要求，部分单位会明确公示政审范围及标准。
3. 准备证明材料：若父亲犯罪记录可能影响政审，可提前准备父亲的无犯罪记录证明（若符合条件）、法院判决书（说明犯罪性质）、儿子个人表现证明等材料，争取通过审查。

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的法律风险。