即便老板被抓，员工的工资权益依然受到法律保护，公司有义务按时、足额支付员工工资。以下是从不同情况出发，对员工工资发放问题的详细解答：
一、公司正常运营情况下的处理方式
协商解决：
- 员工应首先尝试与公司的人力资源部门、财务部门或其他负责人员沟通，了解工资发放的具体情况和计划。
- 双方可依据劳动合同中的约定，就工资支付的时间和金额进行协商，确保工资能够按时发放。
检查劳动合同和公司规章制度：
- 员工应仔细查阅劳动合同和公司相关的规章制度，特别是关于薪资发放的具体条款，确保了解自己的工资权益和支付规定。
- 如合同中有明确的工资支付条款，员工可据此维护自己的权益，要求公司按照合同约定支付工资。
向劳动监察部门投诉：
- 若协商无果，员工可向当地劳动监察部门投诉，提交相关证据（如劳动合同、工资条、考勤记录等）以证明自己与公司存在劳动关系及工资拖欠事实。
- 劳动监察部门有权调查并责令公司限期支付拖欠工资，员工可借此途径维护自己的合法权益。
申请劳动仲裁：
- 如投诉未能解决问题，员工可直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 仲裁过程中，员工需准备好相关证据，仲裁委员会将根据证据和陈述进行审理，并作出具有法律效力的裁决，要求公司支付拖欠的工资。
二、公司停止运营或破产情况下的处理方式
关注公司资产状况与重组动态：
- 员工应密切关注公司的资产状况和重组进展，以便及时了解自己的工资债权可能受到的影响。
- 如公司有资产可处置，员工可推选代表与公司协商资产处置方案及工资支付计划，确保工资能够得到支付。
申请破产清算：
- 如公司资不抵债进入破产程序，员工需及时向破产管理人申报债权，提供劳动合同、工资条等证明材料。
- 根据《中华人民共和国企业破产法》，破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，将首先支付职工的工资和相关费用，员工可借此途径获得工资支付。
追究股东责任（特定情况）：
- 在特定情况下，如股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任逃避债务，严重损害公司债权人利益，员工可要求股东对公司债务承担连带责任。
- 追究股东责任需满足一定法律条件和证明要求，通常需通过诉讼程序实现，员工可咨询专业律师以了解具体操作流程。
三、法律建议与注意事项
保留证据：
- 在处理薪资问题时，员工应妥善保留劳动合同、工资条、银行转账记录等相关证据，以便在需要时证明自己的工资权益。
注意维权时效：
- 员工需注意维权时效问题，避免超过法定时效期限而丧失维权机会。一般来说，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
区分老板个人责任与公司责任：
- 老板个人因刑事案件被抓并不必然导致公司无需支付工资。公司作为独立法人主体，有义务履行支付工资的责任。员工应明确这一点，避免因误解而放弃维权。
综上所述，无论公司老板是否被抓，员工的工资权益都受到法律的严格保护。在面对工资问题时，员工应保持冷静、理性应对，并积极寻求帮助和支持。首先尝试与公司内部协商；若协商无果，则依次考虑向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或诉讼等途径。同时，员工也应关注公司的运营状况和资产动态，以确保在必要时能够采取适当的措施来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。