代理商跑路，员工直接找总部赔偿是否合理，需分情况讨论：
若代理商与总部存在劳动关系或隶属关系：
- 在这种情况下，代理商实际上是总部的一个部门或分支机构，其员工与总部之间存在直接的劳动关系。因此，当代理商跑路时，员工有权直接向总部主张赔偿，包括但不限于工资、经济补偿金、社会保险等。总部作为用人单位，应当承担相应的法律责任。
若代理商与总部为独立法人关系，但存在业务合作或代理关系：
- 在这种情况下，代理商与总部是两个独立的法律主体。员工与代理商之间存在劳动关系，而与总部之间则没有直接的劳动关系。因此，当代理商跑路时，员工原则上应首先向代理商主张赔偿。然而，如果总部在业务合作或代理关系中存在过错，如未尽到合理的监督义务、提供了不实的业务信息等，导致代理商无法履行对员工的义务，那么员工可能有权依据相关法律规定，向总部主张部分或全部赔偿责任。但这需要具体分析过错程度、因果关系等因素。
若代理商与总部为完全独立的法律主体，且无过错关联：
- 在这种情况下，代理商与总部之间既没有劳动关系，也没有业务合作或代理关系中的过错关联。因此，当代理商跑路时，员工只能向代理商主张赔偿，而无法直接向总部主张。如果代理商无法支付赔偿，员工可能需要通过法律途径（如申请劳动仲裁、提起诉讼等）来维护自己的权益。
法律建议：
- 收集证据：员工应尽可能收集与代理商和总部相关的证据，包括劳动合同、工资单、工作证明、业务合作协议等，以证明自己与代理商的劳动关系以及总部在其中的角色和责任。
- 咨询专业律师：在处理此类复杂法律问题时，建议员工咨询专业律师，以便更准确地了解自己的权益和可能的法律途径。
- 及时主张权益：一旦发现代理商跑路或无法支付赔偿，员工应及时向相关部门（如劳动监察部门、法院等）主张自己的权益，避免超过法定时效期间。
可能法律后果：
- 如果员工能够证明总部在代理商跑路事件中存在过错或法律责任，那么总部可能需要承担相应的赔偿责任。
- 如果员工无法证明总部的责任或总部确实无过错，那么员工可能只能向代理商主张赔偿，且可能面临赔偿无法到位的风险。
总之，代理商跑路员工找总部赔偿是否合理，需根据具体情况分析。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。