双方达成协议后，法院是否还会执行，这主要取决于协议的性质、内容以及是否已经得到法院的确认或处理。以下从不同情况进行分析：
协议未经法院确认或处理
- 如果双方达成的协议是私下协商的结果，没有经过法院的确认或处理，那么该协议本身并不具备强制执行力。在这种情况下，如果一方不履行协议，另一方不能直接向法院申请强制执行，而需要先通过诉讼或其他法律途径确认协议的效力，并获得法院的判决或裁定后，才能申请强制执行。
协议已经法院确认并制作成调解书
- 如果双方在诉讼过程中达成了协议，并且该协议已经法院确认，制作成了调解书，那么该调解书就具有强制执行力。根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，调解书经双方当事人签收后，即具有法律效力。如果一方不履行调解书确定的义务，另一方可以直接向法院申请强制执行。
协议已经法院处理并作为判决的一部分
- 在某些情况下，双方达成的协议可能作为法院判决的一部分。例如，在离婚诉讼中，双方可能就财产分割、子女抚养等问题达成协议，法院在审理后认为协议合法有效，并将其作为判决的一部分。在这种情况下，该协议同样具有强制执行力。如果一方不履行判决确定的义务，另一方也可以直接向法院申请强制执行。
法律建议：
- 为了确保协议的强制执行力，建议双方在达成协议后，尽量通过法院进行确认或处理，如申请制作调解书或作为判决的一部分。
- 如果协议未经法院确认或处理，且一方不履行协议，另一方应及时通过诉讼或其他法律途径维护自己的权益。
- 在签订协议时，应明确协议的内容、履行方式、违约责任等条款，以便在发生争议时能够有据可依。
可能后果：
- 如果协议未经法院确认或处理，且一方不履行协议，另一方可能面临无法直接申请强制执行的风险，需要通过诉讼等法律途径解决争议，这可能会增加时间成本和诉讼成本。
- 如果协议已经法院确认或处理，并具有强制执行力，但一方仍不履行义务，那么该方可能面临法院的强制执行措施，如查封、扣押、冻结财产等。
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