双方签订的协议本身不能直接申请法院执行，但满足特定条件时，可依据协议申请强制执行。具体分析如下：

1. 协议需具有可执行性
   根据《民事诉讼法》第243条，申请强制执行的前提是存在生效的法律文书（如判决书、裁定书、调解书、支付令、仲裁裁决书或公证债权文书）。若双方仅签订普通协议，未经过司法确认或公证赋予强制执行力，则无法直接申请执行。
   例外情形：若协议经公证处公证并赋予强制执行效力（如《具有强制执行效力的债权文书公证书》），则可直接向法院申请执行，无需另行诉讼。

2. 需通过诉讼或仲裁确认协议效力
   若协议未公证，需先通过以下途径将协议内容转化为可执行的法律文书：

   • 诉讼途径：向法院起诉要求履行协议，胜诉后取得生效判决书/调解书，再申请执行；
     
   • 仲裁途径：若协议约定仲裁条款，可申请仲裁裁决，凭裁决书申请执行。
     关键点：协议内容需合法有效（如无欺诈、胁迫、显失公平等情形），否则可能被法院或仲裁机构撤销或变更。

3. 协议内容需明确具体
   即使协议经公证或诉讼确认，若内容模糊（如未约定履行期限、金额、方式等），法院可能因“执行标的不明确”而拒绝受理。因此，协议应尽量细化权利义务，避免歧义。

建议：

• 若希望快速实现债权，可优先选择公证债权文书方式，节省诉讼时间；
  
• 若协议已签订但未公证，建议及时通过诉讼/仲裁固定权利，再申请执行；
  
• 签订协议前，可委托律师审核条款，确保合法有效且具备可执行性。
  

如有具体协议或纠纷，可进一步向我说明细节，我会为您分析执行路径。