您好，关于您提出的“入职后公司是否会留毕业证”的问题，我可以明确地告诉您，公司不应该留存您的毕业证原件。

根据人力资源社会保障部的明确回应，“扣证件”是典型的求职陷阱，任何单位和个人都没有权利扣留他人证件原件。毕业证作为您的个人重要证件，包含了您的学历信息等关键内容，其原件应由您本人妥善保管。

在入职过程中，如果公司需要查验您的学历信息，您只需向相关人员出示毕业证原件即可，无需上交。如果公司确实需要留存您的学历证明，您可以提供毕业证的复印件或影印件，并在合适位置注明具体用途，以防止复印件被滥用。

此外，我还想提醒您，在求职和入职过程中，除了警惕“扣证件”外，还要注意防范其他求职陷阱，如以各种名义收取费用、不签订书面劳动合同或合同内容存在不合理条款等。这些行为都可能侵犯您的合法权益，因此您需要保持警惕，谨慎对待。

如果您在入职过程中遇到任何问题或疑虑，建议及时向劳动监察部门或人社部门咨询和投诉举报，以维护自己的合法权益。希望这些信息能对您有所帮助，如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。