综合工时制下，岗位工资一般是不应被随意扣除的，但具体是否可以扣除需结合劳动合同、公司规章制度以及相关法律法规来综合判断。以下从不同角度为你详细分析：
从劳动合同和公司规章制度角度
- 劳动合同约定：如果劳动合同中明确规定了岗位工资的构成、支付条件以及在何种情况下可以扣除，那么双方都应按照合同约定执行。例如，合同中约定因员工个人原因导致公司遭受损失，且该损失与员工岗位直接相关时，公司可以按照一定比例扣除岗位工资作为赔偿，这种情况下扣除可能是合法的。但扣除的比例和方式必须合理，不能违反法律法规的强制性规定。
- 公司规章制度：公司规章制度也是判断是否可以扣除岗位工资的重要依据。如果公司规章制度中明确规定了扣除岗位工资的情形、程序和标准，并且该规章制度经过了民主程序制定（如职工代表大会或全体职工讨论通过）、公示（如在公司内部公告栏张贴、通过电子邮件发送给员工等）且不违反法律法规的强制性规定，那么公司可以依据规章制度扣除岗位工资。例如，公司规章制度规定员工旷工一天，扣除当天岗位工资的200%，这种规定可能因扣除比例过高而不合理，可能被认定为无效。
从法律法规角度
- 《工资支付暂行规定》：该规定明确指出，用人单位不得克扣劳动者工资，但有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：（一）用人单位代扣代缴的个人所得税；（二）用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；（三）法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；（四）法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。除此之外，用人单位不得随意扣除劳动者工资。岗位工资作为工资的一部分，同样适用这一规定。
- 地方性法规：不同地区可能根据本地实际情况制定了地方性工资支付法规，对工资扣除有更详细的规定。例如，某些地区可能规定，因员工原因给公司造成经济损失，公司要求员工赔偿的，每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。如果公司扣除岗位工资的比例超过了这些限制，那么扣除行为可能是违法的。
特殊情况分析
在综合工时制下，如果员工的工作时间超过了法定标准工作时间，公司应按照相关规定支付加班工资。如果公司以各种理由扣除岗位工资来抵消加班工资，这是绝对不允许的。加班工资的计算方式通常为：工作日加班，支付不低于工资的150%的工资报酬；休息日加班又不能安排补休的，支付不低于工资的200%的工资报酬；法定休假日加班的，支付不低于工资的300%的工资报酬。
给你的建议：
- 如果公司要扣除你的岗位工资，你有权要求公司出具相关的依据，如劳动合同条款、公司规章制度规定等，并核实这些依据是否合法有效。
- 如果认为公司扣除岗位工资的行为违法，你可以先与公司协商解决；协商不成的，可以向当地劳动监察部门投诉，或者依法申请劳动仲裁、提起诉讼来维护自己的合法权益。
如果你在综合工时制下遇到岗位工资被扣除的问题，或者有其他相关的法律疑问，都可以直接向我咨询。