确认存量国有建设用地合法性的核心在于核查其权属来源、规划许可及审批程序是否符合法律规定，具体可从以下角度综合判断：

1. 核查土地权属来源文件
   需审查土地使用权人是否持有合法有效的权属证明，包括：

   • 国有土地使用证：确认证书是否由县级以上人民政府颁发，记载用途、面积、期限等信息是否与现状一致；
     
   • 出让合同/划拨决定书：若为出让土地，需核对合同是否明确约定土地用途、容积率等规划条件；若为划拨土地，需确认是否符合《划拨用地目录》规定的公益性用途；
     
   • 权属变更文件：如涉及转让、继承、抵押等，需审查变更登记手续是否完备，是否存在限制性条款（如禁止改变用途）。

2. 验证规划许可合规性
   土地使用需符合国土空间规划（原城乡规划），重点核查：

   • 规划条件：确认土地出让或划拨时附带的规划条件（如建筑密度、绿地率）是否与现状一致；
     
   • 建设用地规划许可证：若涉及新建或改建，需核查是否取得该许可证，且许可内容与实际建设相符；
     
   • 规划变更程序：若土地用途或规划条件发生变更，需确认是否依法经自然资源主管部门批准，并补缴土地出让金（如涉及出让土地）。

3. 审查审批程序完整性
   需确认土地使用过程是否履行法定审批流程：

   • 供地程序：出让土地需通过招标、拍卖、挂牌等公开方式，划拨土地需符合法定情形（如国家机关用地、军事用地）；
     
   • 环保、人防等专项审批：若涉及特殊行业或地下空间开发，需核查是否取得环保、人防等部门批准；
     
   • 竣工验收备案：若为已建成项目，需确认是否通过规划、消防、环保等部门联合验收，并完成竣工备案。

4. 排查潜在法律风险

   • 闲置土地认定：若土地闲置满2年，政府可能无偿收回，需核查是否存在闲置情形及是否已处置；
     
   • 抵押或查封状态：通过不动产登记中心查询土地是否被抵押或查封，避免权属纠纷；
     
   • 政策合规性：确认土地使用是否符合当前产业政策（如“退二进三”、环保限批等），避免因政策调整导致合法性瑕疵。

建议行动步骤：

1. 向当地不动产登记中心申请查询土地权属档案，核实权属来源及变更记录；
   
2. 委托专业机构对土地进行尽职调查，包括规划合规性、审批程序完整性等；
   
3. 若发现瑕疵（如规划变更未补缴出让金），及时与自然资源主管部门沟通补办手续；
   
4. 涉及复杂情形（如历史遗留问题、权属争议），可进一步向我咨询具体解决方案。