用水不足一吨按一吨收费是否合法，需分情况讨论：

1. 若该收费标准由供水合同明确约定：

   • 在民事合同关系中，双方有权在平等、自愿的基础上约定合同条款。如果供水合同中明确规定了“用水不足一吨按一吨收费”的条款，并且该条款不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么这一条款就是有效的。
   • 在这种情况下，用户作为合同的一方，应当遵守合同约定，按照约定的标准支付水费。如果用户对此有异议，可以通过协商、调解或诉讼等方式解决争议，但在合同未被撤销或变更前，仍需履行合同义务。

2. 若该收费标准未由供水合同明确约定，或约定不明确：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同相关条款或者交易习惯确定。
   • 如果供水合同中没有明确约定“用水不足一吨按一吨收费”的条款，或者约定不明确，且双方无法就收费标准达成补充协议，那么供水方单方面按照一吨收费可能缺乏法律依据。
   • 在这种情况下，用户有权拒绝按照供水方的单方面标准支付水费，并可以通过协商、投诉或诉讼等方式维护自己的合法权益。

3. 若该收费标准违反法律法规或行政规章的强制性规定：

   • 如果供水方制定的收费标准违反了国家关于水价管理的法律法规或行政规章的强制性规定，比如超过了政府指导价或政府定价的范围，那么这一收费标准就是无效的。
   • 在这种情况下，用户不仅有权拒绝按照无效的收费标准支付水费，还可以向相关部门投诉或举报供水方的违法行为，要求其承担相应的法律责任。

法律建议：

• 对于用户而言，如果遇到供水方按照“用水不足一吨按一吨收费”的标准收费，首先应当查看供水合同中的相关条款，确认该标准是否由合同明确约定。
• 如果合同中没有明确约定或约定不明确，用户可以与供水方协商解决争议；协商不成的，可以向当地的水务管理部门或消费者协会投诉，或者通过诉讼途径维护自己的合法权益。
• 同时，用户也应当注意保留好相关的证据材料，如供水合同、水费账单等，以便在争议解决过程中提供有力的支持。

可能后果：

• 如果供水方的收费标准合法有效，用户拒绝支付水费可能面临供水方停止供水、追缴欠费及违约金等法律后果。
• 如果供水方的收费标准违法无效，用户有权拒绝支付超出合理范围的水费，并可能要求供水方承担因违法行为给用户造成的损失。