政府采购未在两个工作日内公示合同，属于违反政府采购信息公开规定的行为，采购人或采购代理机构应当承担相应的法律责任，并需及时采取补救措施。具体处理方式如下：

1. 法律责任与后果
   根据《中华人民共和国政府采购法实施条例》第五十条及第六十七条，采购人或采购代理机构未按规定公示合同（包括未在签订后2个工作日内公告）的，由财政部门责令改正，并可能面临警告、罚款等行政处罚。若因未公示导致供应商权益受损，供应商可依法主张权利（如投诉、举报或要求赔偿）。

2. 补救措施

   • 立即公示：发现未公示后，应第一时间在省级以上财政部门指定的媒体（如中国政府采购网）上补发合同公告，确保信息透明。
     
   • 书面说明：向财政部门提交书面报告，说明未及时公示的原因及整改情况，避免进一步处罚。
     
   • 内部整改：完善政府采购内部管理制度，明确合同公示的责任部门和流程，防止类似问题再次发生。

3. 供应商救济途径
   若供应商因合同未公示遭受损失（如无法及时了解合同内容导致权益受损），可：

   • 向采购人或采购代理机构提出书面质疑；
     
   • 对质疑答复不满的，向财政部门提起投诉；
     
   • 依法申请行政复议或提起行政诉讼。

建议：政府采购各方主体应严格遵守信息公开时限要求，避免因程序瑕疵引发法律风险。若已发生未公示情况，需尽快补救并主动与财政部门沟通，降低负面影响。如有具体案件细节需进一步分析，可直接向我咨询。