结论：公司因员工抽烟引起火灾而罚款40000元后，后续追偿是否合法，需根据具体情况判断，包括罚款的合法性、追偿的依据以及员工过错程度等。

分析：

1. 罚款的合法性：

   • 首先，需要明确的是，公司并非行政机关，不具有行政处罚权。因此，公司直接对员工处以罚款，在法律上可能缺乏直接依据。但公司可以通过内部规章制度，对员工的违规行为进行纪律处分，如警告、记过、降职、解雇等，并可能根据规章制度扣除相应的奖金或绩效。
   • 如果公司所谓的“罚款”实际上是通过扣除工资或奖金的方式实现，那么需要确保这种扣除符合《劳动合同法》及相关法律法规的规定，即扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。

2. 追偿的依据：

   • 如果火灾确实由员工的抽烟行为引起，且该行为构成对公司的财产损害或违反了公司的安全规定，公司有权要求员工承担相应的赔偿责任。
   • 追偿的依据可以是《民法典》中关于侵权责任的规定，即因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。在这种情况下，员工因抽烟引发火灾，显然存在过错，因此应承担相应的赔偿责任。

3. 员工过错程度与追偿金额：

   • 追偿的金额应与员工的过错程度相适应。如果员工只是轻微疏忽，且火灾造成的损失不大，那么追偿的金额也应相对较小。
   • 如果员工存在故意或重大过失，且火灾造成了重大损失，那么公司有权要求员工承担更大的赔偿责任。但即便如此，追偿的金额也应合理，不得过分高于实际损失。

4. 后续追偿的合法性：

   • 如果公司已经通过扣除工资或奖金的方式“罚款”了40000元，且这部分扣除符合法律法规和公司规章制度的规定，那么公司再要求员工进行后续追偿可能缺乏合法性，因为这可能构成对员工的双重处罚。
   • 如果公司尚未通过扣除工资或奖金的方式实现“罚款”，而是直接要求员工支付40000元作为赔偿，那么需要评估火灾造成的实际损失以及员工的过错程度，以确定追偿的金额是否合理。

建议：

• 对于公司而言，应首先确保内部规章制度的合法性和合理性，明确员工违规行为的处理方式和赔偿标准。
• 在发生火灾等事故后，公司应及时调查事故原因，确定责任方，并依法进行追偿。追偿的金额应合理，不得过分高于实际损失。
• 对于员工而言，如果认为公司的处罚或追偿不合理，可以与公司进行协商，或者通过法律途径维护自己的合法权益。

可能法律后果：

• 如果公司未经合法程序对员工进行罚款或追偿，员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求公司返还非法扣除的款项或赔偿损失。
• 如果员工因抽烟引发火灾且存在过错，公司有权要求员工承担相应的赔偿责任。但如果追偿的金额不合理或缺乏合法依据，员工也有权拒绝支付或寻求法律救济。