关于营运公司在停运期间收取管理费是否合法的问题，不能一概而论，需要分情况讨论：
合同有明确约定：
- 如果营运公司与相关方（如车主、驾驶员等）在合同中明确约定了停运期间仍需支付管理费，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么这种约定是有效的。在这种情况下，营运公司收取管理费是合法的，相关方应当按照合同约定履行支付义务。
合同无明确约定或约定不明：
- 如果合同中没有明确约定停运期间的管理费问题，或者约定不明确，那么就需要根据具体情况来判断。一般来说，管理费是营运公司为提供管理服务而收取的费用，如果停运期间营运公司并未提供实际的管理服务，或者提供的管理服务显著减少，那么要求相关方支付全额管理费可能缺乏合理性。
- 在这种情况下，营运公司如果仍然坚持收取管理费，可能会面临法律上的挑战。相关方可以主张管理费过高或不合理，要求调整或免除部分费用。如果双方无法协商一致，可能需要通过法律途径解决争议，如提起诉讼或申请仲裁。
法律原则与公平性考量：
- 无论合同是否有明确约定，法律都强调公平原则。如果营运公司在停运期间收取的管理费明显过高，或者对相关方造成了不公平的负担，那么这种收费行为可能违反法律原则，不被法律所保护。
- 此外，如果停运是由于不可抗力（如自然灾害、政府行为等）导致的，且营运公司因此遭受了损失，那么双方可以协商分担损失的方式，包括是否调整管理费等。
法律建议：
- 对于营运公司而言，在签订合同时应当明确约定停运期间的管理费问题，以避免后续争议。同时，在停运期间应当根据实际情况合理调整管理费标准，确保收费的合理性和公平性。
- 对于相关方而言，如果认为营运公司收取的管理费不合理或过高，应当及时与营运公司沟通协商，寻求解决方案。如果协商无果，可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果营运公司违法收取管理费，可能面临行政处罚（如罚款、没收违法所得等）和民事赔偿（如退还多收的管理费、赔偿损失等）的法律后果。
- 如果相关方拒不支付合理的管理费，营运公司也有权通过法律途径追讨欠款，并可能要求相关方承担违约责任。
总之，营运公司在停运期间收取管理费是否合法，需要根据合同约定、实际情况以及法律原则进行综合判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。