结论前置：持有公司100%股权的大股东，在符合公司章程和相关法律法规的前提下，通常有权更换公司的法定代表人（即法人代表）。但这一过程必须严格遵循法定程序和公司章程的具体规定。
法律背景与程序
法定代表人的定义与变更：
- 法定代表人是指依法代表法人行使民事权利，履行民事义务的主要负责人。根据《中华人民共和国公司法》第十三条，公司法定代表人依照公司章程的规定，由董事长、执行董事或者经理担任，并依法登记。
- 更换法定代表人需要办理变更登记手续，且必须遵循一定的程序和决策机制。
大股东的权力基础：
- 作为持有公司100%股权的大股东，您在公司决策中拥有绝对的控制权。根据《公司法》的规定，股东会会议由股东按照出资比例行使表决权。因此，在更换法定代表人的问题上，您的表决权足以推动相关决议的通过。
更换法定代表人的具体流程：
- 召开股东会：作为大股东，您可以提议召开临时股东会，并按照公司章程的规定通知其他股东（尽管在此情况下可能没有其他股东）。在会议上，提出更换法定代表人的议案并进行表决。
- 形成决议：股东会表决通过后，需要形成正式的股东会决议。这是办理法定代表人变更登记的重要文件之一。
- 修改公司章程（如需要）：如果公司章程中对法定代表人的相关内容有规定，应根据股东会决议对公司章程进行相应修改。
- 办理变更登记：公司需向公司登记机关提交相关文件，包括变更登记申请书、依照《公司法》作出的变更决议或决定等，申请法定代表人的变更登记。
特殊情况与注意事项
公司章程的特殊约定：
- 尽管您持有100%的股权，但如果公司章程对更换法定代表人设置了更为严格的条件（如必须经全体股东一致同意，尽管在此情况下这不太可能），您仍需遵守这些规定。不过，在您持有全部股权的情况下，这种特殊约定实际上不会构成障碍。
法定代表人的合法权益保护：
- 如果原法定代表人依据与公司签订的协议享有相应权益（如任期未满、有特定职责等），更换法定代表人可能涉及违约等法律问题。在更换前，您应妥善处理这些权益纠纷，以避免潜在的法律风险。
内部沟通与协调：
- 在更换法定代表人前，建议您与公司内部各部门进行充分沟通，确保变更工作的顺利进行。这有助于减少因变更带来的业务中断或内部混乱。
后续手续与通知：
- 更换法定代表人后，您还需及时办理税务、银行账户、社保与公积金账户等相关证件与信息的变更手续。同时，通知合作伙伴、客户、供应商等相关方关于法定代表人变更的信息，以确保业务的正常进行。
法律后果与建议
- 法律后果：如果未能严格遵循法定程序和公司章程的规定更换法定代表人，可能导致变更无效或面临法律纠纷。因此，务必确保整个过程的合法性和合规性。
- 建议：作为持有100%股权的大股东，您在更换法定代表人方面拥有较大的权力。但为了确保变更的顺利进行和避免潜在的法律风险，我建议您在操作前仔细审查公司章程和相关法律法规的规定，并咨询我以获取更具体的法律指导。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。