投标主体和签合同主体不一致，在一般情况下是不被允许的，但具体是否合法需根据实际情况和法律法规进行判断。以下从多个角度对此问题进行分析：
一、法律法规层面
《民法典》相关规定：
- 合同是平等主体的自然人、法人、其他组织之间设立、变更、终止民事权利义务关系的协议。合同的签订应当遵循诚实信用原则，且合同主体应当具有相应的民事权利能力和民事行为能力。
- 如果投标主体和签合同主体不一致，且没有合法的代理关系或主体变更手续，那么这种不一致可能构成对合同诚实信用原则的违反，甚至可能导致合同无效。
《招标投标法》及其实施条例：
- 招标投标活动应当遵循公开、公平、公正和诚实信用的原则。招标人与中标人应当按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同，且合同的标的、价款、质量、履行期限等主要条款应当与招标文件和中标人的投标文件的内容一致。
- 如果投标主体和签合同主体不一致，且没有合理的解释和合法的依据，那么这种不一致可能被视为对招标投标法规的违反，从而面临行政处罚或法律纠纷。
二、实际操作层面
查明不一致原因：
- 当发现投标主体和签合同主体不一致时，首先应当通过沟通协商和查阅相关文件（如招标文件、投标文件、招投标记录等）来查明不一致的具体原因。
- 原因可能包括但不限于：存在委托代理关系、主体变更、错误或违规等。
判断合法性：
- 如果不一致是由于合法的代理关系或主体变更导致的，并且已经按照相关规定进行了披露和备案，那么这种不一致可能是合法的。
- 如果不一致是由于错误或违规导致的，或者没有合法的依据和披露手续，那么这种不一致可能是违法的。
采取纠正措施：
- 如果不一致是由于错误或违规导致的，应当及时采取纠正措施，如由招标人重新与中标人签订合同，确保合同主体的一致性。
- 如果存在合法的委托关系或主体变更，应当完善相关手续，如签订明确的委托代理合同或补充协议，并确保备案。
三、法律后果层面
民事责任：
- 如果因投标主体和签合同主体不一致造成损失的，过错方应当承担相应的赔偿责任。
行政责任：
- 如果违反招投标法规的，行政主管部门可以处以罚款、暂停或取消招标代理资格等处罚。
刑事责任：
- 在极端情况下，如果涉及严重违法犯罪行为的（如串通投标、行贿受贿等），将依法追究刑事责任。
四、建议与措施
加强沟通与协商：
- 在招标投标过程中，招标人与中标人应当保持密切沟通，确保对合同主体等关键事项达成一致理解。
完善手续与备案：
- 如果存在委托代理关系或主体变更等情况的，应当及时签订相关合同或补充协议，并按照规定进行备案。
寻求法律帮助：
- 如果对投标主体和签合同主体不一致的问题存在疑问或争议的，建议及时咨询专业律师或相关机构以获取法律帮助。
综上所述，投标主体和签合同主体不一致在一般情况下是不被允许的，但具体是否合法需根据实际情况和法律法规进行判断。在处理此类问题时，应当遵循法律法规的规定，确保各方权益得到妥善保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。