结论前置：公司和员工解除劳动关系时，若员工未交接工作导致公司损失，公司可以通过多种途径来维护自身权益，包括要求员工赔偿损失、在解除劳动合同协议中约定相关条款、通过劳动仲裁或诉讼解决等。以下是对这些途径的详细分析：
要求员工赔偿损失：
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。虽然该条款未直接提及工作交接，但工作交接是劳动合同解除后劳动者的附随义务，若因未交接导致公司损失，可参照此精神要求赔偿。
- 实际操作：公司应首先与员工进行沟通，明确指出未交接工作给公司造成的具体损失，并要求员工进行赔偿。若员工拒绝，公司可以收集相关证据，如损失的具体金额、未交接工作的具体内容等，为后续的法律程序做准备。
在解除劳动合同协议中约定相关条款：
- 预防措施：为了避免未来可能出现的纠纷，公司在与员工解除劳动合同时，可以在解除协议中明确约定工作交接的具体要求、时间限制以及未交接工作的法律后果，包括赔偿损失等。
- 法律效力：一旦双方签订了解除劳动合同协议，并明确了相关条款，该协议即具有法律效力。若员工未按照协议要求交接工作，公司可以依据协议要求员工承担相应的法律责任。
通过劳动仲裁或诉讼解决：
- 劳动仲裁：若公司与员工之间无法就赔偿问题达成一致，公司可以向当地的劳动仲裁委员会申请劳动仲裁。劳动仲裁委员会将根据双方提供的证据和法律规定，作出裁决。
- 诉讼：若对劳动仲裁结果不满意，公司还可以向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，公司需要提供充分的证据来证明员工未交接工作给公司造成的损失，以及要求员工赔偿的合理性。
额外建议：
- 完善公司制度：公司应建立健全的工作交接制度，明确工作交接的流程、要求和责任。这样可以在未来出现类似情况时，有明确的制度依据来处理。
- 保留证据：在与员工沟通工作交接问题时，公司应保留好相关的沟通记录、邮件、短信等证据。这些证据在后续的法律程序中可能起到关键作用。
- 寻求专业帮助：若公司在处理此类问题时遇到困难或不确定如何操作，可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供专业的法律意见和指导，帮助公司更好地维护自身权益。
可能遇到的法律后果：
- 若公司能够证明员工未交接工作给公司造成了实际损失，并且该损失与员工未交接工作之间存在因果关系，那么员工可能需要承担赔偿责任。
- 若公司无法提供充分的证据来证明损失的存在或损失与员工未交接工作之间的因果关系，那么公司可能无法获得赔偿。
总之，公司在处理员工未交接工作导致损失的问题时，应综合考虑多种途径来维护自身权益。同时，公司也应加强内部管理，完善相关制度，以预防未来可能出现的类似问题。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。