结论：在工伤认定及赔偿的案件中，如果分公司依法取得营业执照或登记证书，您确实可以同时将分公司和总公司列为被告。不过，具体是否需要同时起诉两者，需根据实际情况和诉讼策略来决定。

详细分析：

1. 分公司的法律地位与责任：

   • 分公司作为总公司的分支机构，虽不具有独立法人资格，但在依法取得营业执照或登记证书后，可以独立作为用人单位与劳动者签订劳动合同，并因此具备作为工伤认定主体的资格。这意味着，分公司可以为其员工申请工伤认定，并在工伤事故中承担直接责任。
   • 然而，由于分公司不具备独立的法律人格，其在民事责任上的承担能力可能有限。在分公司无法独立承担全部责任时，总公司需承担相应的补充责任。

2. 同时起诉分公司和总公司的法律依据：

   • 根据《工伤保险条例》及相关法律规定，用人单位（包括分公司）有义务为职工申请工伤认定，并在职工发生工伤时承担相应的赔偿责任。
   • 在分公司无法独立承担全部赔偿责任的情况下，总公司作为分公司的上级机构，其民事责任是连带且不可分割的。因此，您有权同时将分公司和总公司列为被告，要求它们共同承担赔偿责任。

3. 实际诉讼策略考虑：

   • 同时起诉的优点：同时起诉分公司和总公司可以确保您的权益得到更全面的保障。即使分公司资产有限或无法独立承担全部责任，总公司也可以作为补充责任主体，确保您能够获得应有的赔偿。
   • 单独起诉的考虑：在某些情况下，如果分公司资产充足且能够独立承担全部责任，您也可以选择仅起诉分公司。然而，这需要您对分公司的财务状况有充分的了解，并承担分公司可能无法履行赔偿义务的风险。
   • 诉讼策略建议：在决定是否同时起诉分公司和总公司时，建议您综合考虑分公司的财务状况、总公司的偿付能力以及诉讼成本等因素。如果分公司资产有限或存在无法履行赔偿义务的风险，同时起诉分公司和总公司将是更稳妥的选择。

4. 实际操作中的注意事项：

   • 在提起诉讼前，建议您先收集充分的证据，包括工伤认定决定书、医疗费用单据、劳动合同等，以证明您的工伤事实及与分公司之间的劳动关系。
   • 在起诉时，您需要明确列出分公司和总公司的名称、地址等基本信息，并详细陈述您的诉讼请求及事实理由。
   • 在诉讼过程中，您需要积极配合法院的调查和审理工作，及时提供证据材料并参加庭审活动。

总结与建议： 在工伤认定及赔偿的案件中，如果分公司依法取得营业执照或登记证书，您确实可以同时将分公司和总公司列为被告。不过，具体是否需要同时起诉两者，需根据实际情况和诉讼策略来决定。如果您对分公司的财务状况或总公司的偿付能力存在疑虑，或者希望确保自己的权益得到更全面的保障，同时起诉分公司和总公司将是更稳妥的选择。如果您在此过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。