可以申请保护现场，但需结合具体情形和目的来操作，以下是详细分析：
- 从固定证据角度
若甲方拖欠工程款，为防止现场被破坏导致关键证据灭失（如施工范围、质量标准、工程量等），承包方有权主动采取保护措施。例如：
- 对现场进行拍照、录像，记录施工状态；
- 封存关键材料、设备，避免被转移或损毁；
- 必要时可委托公证机构对现场状况进行公证，增强证据效力。
这些措施属于自行取证范畴，无需额外申请，但需确保不违反法律或合同约定（如不得擅自拆除已完工部分）。
- 从法律程序角度
若希望通过司法途径解决纠纷，可向法院申请财产保全或证据保全：
- 财产保全：针对甲方财产（如银行账户、房产、车辆等）申请冻结，防止其转移资产导致判决无法执行。需提供担保并证明债权存在紧迫性。
- 证据保全：若现场状况可能因时间推移或人为因素灭失，可申请法院对现场进行勘验、封存或记录，固定争议事实。
申请需提交书面材料（如起诉状、保全申请书、担保文件等），由法院审查后决定是否准许。
- 从合同约定角度
若合同中明确约定“甲方未付款时，乙方有权暂停施工并保护现场”，则承包方可依据合同主张权利，但需注意：
- 暂停施工需提前通知甲方，避免被认定为违约；
- 保护现场的范围应合理，不得超出必要限度（如不得封锁甲方办公区域）。
行动建议：
- 立即整理合同、施工记录、验收单等证据，证明甲方欠款事实；
- 根据纠纷紧迫性，选择自行取证或申请法院保全；
- 若涉及重大利益，建议同步委托律师起草法律文书，提高维权效率。
如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。