结论前置：员工开车撞了别人车，保险赔付后是否会被扣工资，需分情况讨论，具体如下：
- 若员工在执行工作任务时发生事故
根据《民法典》第1191条，用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任。此时，若保险赔付已覆盖全部损失（如交强险、商业三者险足额赔付），且员工无故意或重大过失（如酒驾、无证驾驶等），用人单位通常无权以“赔偿损失”为由扣减员工工资。
但需注意：若员工存在故意或重大过失，用人单位可依据内部规章制度（如《员工手册》中明确规定的“重大过失导致损失需赔偿”）或劳动合同约定，要求员工承担部分或全部损失。此时，扣减工资需符合《工资支付暂行规定》第16条：
- 每月扣减部分不得超过员工当月工资的20%；
- 扣减后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
- 若员工非因执行工作任务发生事故（如私自用车）
此时事故责任由员工个人承担，与用人单位无关。若保险赔付后仍有不足（如未投保商业险或保额不足），受害方可能直接向员工追偿。用人单位无义务代为赔偿，但若员工因赔偿导致经济困难，用人单位是否扣减工资需看双方约定：
- 若劳动合同或规章制度中明确约定“员工因个人原因导致损失需赔偿”，且赔偿方式包括扣减工资，则用人单位可依法扣减（同样需遵守上述20%和最低工资标准限制）；
- 若无明确约定，用人单位擅自扣减工资可能构成违法，员工可依据《劳动合同法》第38条主张被迫解除劳动合同，并要求支付经济补偿。
建议：
- 对用人单位：完善内部规章制度，明确“执行工作任务”和“非执行工作任务”的赔偿责任划分，并依法履行民主程序（如职工代表大会讨论、公示等），确保扣减工资的合法性；
- 对员工：若因事故被扣减工资，可要求用人单位出具书面依据（如规章制度条款、损失计算明细），若认为扣减不合理，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
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