商标侵权并不完全都是由当地工商部门处理的，处理方式主要有以下两种：

1. 向工商行政管理部门投诉：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国商标法》第六十条的规定，商标注册人或者利害关系人发现商标侵权行为后，可以向工商行政管理部门提出投诉。工商行政管理部门在认定侵权行为成立后，会责令侵权人立即停止侵权行为，并没收、销毁侵权商品和主要用于制造侵权商品、伪造注册商标标识的工具。同时，根据违法经营额的大小，还会处以相应的罚款。
   • 处理流程：投诉与受理、调查取证、审理与裁定、执行与监督。

2. 向人民法院提起诉讼：

   • 法律依据：同样根据《中华人民共和国商标法》第六十条，如果当事人不愿协商或者协商不成，商标注册人或者利害关系人也可以选择向人民法院起诉，要求侵权人承担民事责任或刑事责任（如果构成犯罪的话）。
   • 处理方式：通过司法途径解决商标侵权纠纷，法院会根据事实和法律作出判决，要求侵权人停止侵害、排除妨碍、赔礼道歉、赔偿损失等。

进一步分析：

• 工商行政管理部门处理的优势在于其行政效率较高，能够迅速制止侵权行为，并对侵权人进行行政处罚。这对于保护商标权利人的合法权益、维护市场秩序具有重要意义。
• 人民法院处理的优势则在于其能够通过司法判决明确侵权人的法律责任，并给予商标权利人相应的民事赔偿。同时，如果侵权行为构成犯罪，法院还可以依法追究侵权人的刑事责任。

建议：

• 在发现商标侵权行为后，商标权利人可以根据自身情况和侵权行为的严重程度，选择向工商行政管理部门投诉或向人民法院提起诉讼。
• 如果侵权行为较为严重或涉及金额较大，建议同时考虑向两个部门投诉或起诉，以更全面地保护自己的合法权益。
• 在处理商标侵权纠纷时，务必保留好相关证据材料，如侵权商品、宣传资料、交易记录等，以便在投诉或起诉时提供有力支持。

如果您在商标侵权方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。