定义与事由的区别
商标撤三：根据《中华人民共和国商标法》第四十九条的规定，商标撤三是指商标注册人在注册商标后，无正当理由连续三年不使用该商标，任何单位或个人可以向商标局申请撤销该注册商标。这一制度的主要目的是督促商标注册人积极使用商标，避免商标资源的闲置和浪费。
商标无效：商标无效则是指已注册的商标因违反《商标法》的相关规定，如以欺骗手段或其他不正当手段取得注册，或者侵犯了他人在先权利（如著作权、外观设计专利权、姓名权、肖像权等），由商标局宣告或经其他单位、个人请求由商标评审委员会宣告该商标无效。商标无效是对商标注册时即存在的瑕疵进行纠正的制度。
法律依据的不同
商标撤三：主要依据《商标法》第四十九条，该条款明确规定了商标注册人无正当理由连续三年不使用注册商标的，任何单位或者个人可以向商标局申请撤销该注册商标。
商标无效：则依据《商标法》第四十四条和第四十五条，这些条款详细列举了商标无效的多种情形，包括违反商标法的基本原则、侵犯他人权利等。
处理时效与审查程序的差异
商标撤三：商标局受理撤三申请后，会通知商标注册人提交使用证据。商标注册人需在规定期限内提交证据，商标局进行审查并作出是否撤销的决定。当事人对决定不服的，可以向商标评审委员会申请复审。
商标无效：商标无效可以是商标局依职权宣告，也可以是其他单位或个人向商标评审委员会提出申请。商标评审委员会受理后进行审理并作出裁定。当事人对裁定不服的，可以向人民法院提起行政诉讼。处理时效一般与商标的注册过程或内容是否违法相关，且驰名商标所有人不受五年时间限制。
法律后果的不同
商标撤三：商标被撤销后，商标注册人失去该商标的专用权。但此前的合法注册及使用行为仍然有效，商标注册人可以重新申请注册，但不能基于原商标的知名度主张特殊权益。
商标无效：商标被宣告无效后，其专用权视为自始不存在。从商标注册之日起，所有基于该商标的行为都可能被认定无效，包括许可使用合同、转让合同等，涉及的侵权纠纷也可能重新认定责任。
程序与救济的差异
商标撤三：商标注册人需在规定期限内提交使用证据或说明不使用的正当理由，否则商标将被撤销。对撤销决定不服的，可以依法申请复审或提起诉讼。
商标无效：当事人对商标局或商标评审委员会的决定不服的，可以依法申请复审或提起诉讼，以维护自身合法权益。
总结：商标撤三和商标无效在定义、法律依据、处理时效与审查程序以及法律后果等方面均存在显著差异。在商标管理和维权过程中，应准确理解和区分这两者的不同之处，以确保合法权益得到有效保护。如果您在商标领域遇到任何问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见。