侵犯植物新品种权的处理主要由农业农村主管部门和市场监督管理部门负责，它们分别承担不同的职责。以下是对这两个部门职责的详细解释：

1. 农业农村主管部门：

   • 职责概述：农业农村主管部门是植物新品种权保护的主要监管部门，负责植物新品种的审定、登记、保护以及侵权行为的查处等工作。
   • 具体职责：
     • 审定与登记：对申请植物新品种权的品种进行审定，确认其新颖性、特异性、一致性和稳定性，并予以登记。
     • 保护与管理：制定植物新品种保护政策，监督植物新品种权的实施，保护育种者的合法权益。
     • 侵权查处：对侵犯植物新品种权的行为进行调查取证，依法作出行政处罚决定，如没收违法所得、罚款等，并可以责令侵权人停止侵权行为，包括停止生产、销售侵权品种，没收违法生产的种子和违法所得等。

2. 市场监督管理部门：

   • 职责概述：市场监督管理部门在植物新品种权保护中主要承担市场监管职责，负责查处市场上的假冒伪劣种子和侵犯植物新品种权的行为。
   • 具体职责：
     • 市场监管：对种子市场进行日常监管，检查种子经营者的资质、种子的质量以及是否侵犯植物新品种权等。
     • 侵权查处：对市场上发现的假冒伪劣种子和侵犯植物新品种权的行为进行查处，依法对违法行为人进行处罚，并可以采取措施防止侵权行为继续发生，如查封、扣押侵权物品等。

法律背景与建议：

• 法律背景：植物新品种权是育种者对其培育的植物新品种享有的专有权，受法律保护。任何单位或者个人未经品种权人许可，不得为商业目的生产或者销售该授权品种的繁殖材料，不得为商业目的将该授权品种的繁殖材料重复使用于生产另一品种的繁殖材料。
• 法律建议：如果发现有人侵犯植物新品种权，品种权人可以向当地的农业农村主管部门或市场监督管理部门举报，并提供相关证据。这两个部门将依法进行调查处理，保护品种权人的合法权益。同时，品种权人也可以考虑通过法律途径追究侵权人的民事责任，如提起民事诉讼要求赔偿损失等。

在处理侵犯植物新品种权的问题时，各部门之间会相互协作，共同打击侵权行为，维护市场秩序和育种者的合法权益。如果您在植物新品种权保护方面遇到任何问题，可以直接向我咨询，我将为您提供专业的法律帮助。