侵犯植物新品种权处理由省级以上人民政府农业行政部门负责。具体分析如下：

一. 负责部门

• 省级以上人民政府农业行政部门：根据《农业植物新品种权侵权案件处理规定》第三条，省级以上人民政府农业行政部门负责处理本行政辖区内品种权侵权案件。这意味着，如果发生植物新品种权侵权，应向省级或更高级别的农业行政部门寻求处理。

二. 处理流程与职责

1. 接收请求：农业行政部门会接收来自品种权人或利害关系人的侵权处理请求，并依据规定进行审查。
2. 立案与调查：符合条件的请求，农业行政部门会立案并指定承办人员处理。承办人员会进行必要的调查取证，以确认侵权事实。
3. 作出处理决定：根据调查结果，农业行政部门会作出处理决定，包括责令停止侵权行为、没收违法所得、处以罚款等。
4. 执行与救济：处理决定作出后，当事人必须履行。如不服处理决定，当事人可依法申请行政复议或提起行政诉讼。

综上所述，侵犯植物新品种权的处理由省级以上人民政府农业行政部门负责。他们负责接收请求、立案调查、作出处理决定，并确保决定的执行。如有进一步需要，您可以继续咨询我。