税务机关在征税过程中，并非必须无条件认可生效判决书确认的事实，但生效判决书的既判力会对税务机关的征税行为产生一定约束，具体需分情况讨论：

1. 生效判决书直接涉及税收法律关系时，税务机关通常需认可
   若生效判决已对税收法律关系的核心事实（如纳税主体、计税依据、税收优惠适用等）作出明确认定，税务机关在后续征税中一般应尊重判决结果。例如：

   • 法院判决确认某企业不构成偷税行为，税务机关不得以同一事实再次追缴税款及滞纳金；
     
   • 法院判决认定某笔收入属于免税范围，税务机关需据此调整征税决定。
     依据：根据《税收征收管理法》及司法解释，税务机关的行政行为需与生效判决保持一致，否则可能因“事实认定冲突”被撤销或确认违法。

2. 生效判决书未直接涉及税收法律关系时，税务机关可独立审查
   若判决仅涉及民事或刑事法律关系（如合同效力、侵权赔偿等），但未明确税收法律后果，税务机关仍需根据税法规定独立判断纳税义务。例如：

   • 法院判决确认某笔交易为“赠与”而非“销售”，但未提及赠与是否需缴纳个人所得税，税务机关需依据《个人所得税法》审查赠与是否属于应税行为；
     
   • 法院判决企业承担民事赔偿责任，但未明确赔偿款是否可税前扣除，税务机关需按企业所得税法规定审核扣除合法性。
     依据：税法具有独立性，税务机关的征税权不受其他法律领域判决的直接约束，但需遵循“税收法定原则”和“实质课税原则”。

3. 税务机关发现判决与税法冲突时的处理
   若税务机关认为生效判决存在错误（如错误认定税收优惠条件），可通过以下途径解决：

   • 申请再审或抗诉：若判决涉及税收法律适用错误，税务机关可依法向法院申请再审或请求检察院抗诉；
     
   • 启动税务行政复议或诉讼：若纳税人以判决为依据拒绝纳税，税务机关可作出征税决定，纳税人不服的可通过行政复议或诉讼解决，最终以司法审查结果为准。
     依据：《行政诉讼法》第92条规定，税务机关作为行政机关，对认为确有错误的生效判决，有权通过法定程序寻求救济。

总结建议：

• 对纳税人而言，若持有生效判决，可主动向税务机关提交并说明与税收的关联性，以维护自身权益；
  
• 对税务机关而言，需在尊重判决既判力的前提下，严格依据税法独立审查纳税义务，避免“以判代税”或“机械执行判决”；
  
• 若双方对判决与税法的适用存在争议，建议通过法律程序（如复议、诉讼）明确权利义务，而非单方面坚持己见。
  

如有具体案件或判决内容需要分析，可进一步向我提供细节，我会结合税法与司法实践为您详细解答。