公司罚款用微信转账是不合法的。以下是对此问题的详细解释：

一、法律依据与罚款主体

1. 《中华人民共和国行政处罚法》明确规定，行政处罚由具有行政处罚权的行政机关在法定职权范围内实施。企业，作为非行政机关，并不具备对员工进行罚款的法定权力。罚款是行政处罚的一种，只能由法律授权的行政机关来执行。

2. 《工资支付暂行规定》和《中华人民共和国劳动合同法》中虽然提到了因员工原因给用人单位造成经济损失时，用人单位可以要求赔偿，但这与“罚款”是两个不同的概念。赔偿是基于员工对用人单位造成的实际损失，而罚款则是对员工行为的惩戒，两者性质不同，且赔偿也需通过合法途径进行，如从工资中扣除，但需遵循严格的条件和程序。

二、罚款行为的合法性分析

• 罚款主体不适格：企业无权对员工进行罚款，因为这不是其法定职权范围。罚款是行政处罚的一种，只能由行政机关实施。

• 罚款程序不合法：即使企业认为员工有过错需要经济上的惩戒，也应通过合法途径进行，如依据劳动合同约定要求员工承担赔偿责任，或通过协商、调解等方式解决争议。使用微信转账进行罚款，既缺乏法律依据，也违反了法定程序。

三、微信转账作为罚款方式的违法性

1. 缺乏正式性和可追溯性：微信转账虽然便捷，但作为一种非正式的支付方式，其记录可能难以作为有效的法律证据。在发生争议时，双方可能难以就转账的性质（是罚款还是其他款项）达成一致，这增加了争议解决的难度。

2. 侵犯员工权益：使用微信转账进行罚款，可能让员工感到自己的权益受到侵犯。这种方式缺乏透明度和公正性，容易引发员工的不满和抵触情绪，对企业的员工关系和企业文化产生负面影响。

综上所述，公司罚款用微信转账是不合法的。企业应遵守相关法律法规，通过合法途径解决与员工之间的争议和问题，维护良好的员工关系和企业文化。