公司不能因为员工去仲裁就停发工资。以下从几个角度为你详细分析：

法律角度

根据《中华人民共和国劳动法》以及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这是用人单位的法定义务，不因劳动者是否提起仲裁而免除。如果公司因为员工去仲裁就停发工资，这明显违反了法律规定，员工有权要求公司支付拖欠的工资，并可能因此获得相应的赔偿。

仲裁程序角度

劳动仲裁是解决劳动争议的一种法定方式，员工提起仲裁是为了维护自己的合法权益。仲裁程序本身并不影响公司支付工资的义务。在仲裁期间，公司应当继续履行劳动合同，包括支付工资。如果公司停发工资，不仅可能面临法律责任，还可能影响仲裁结果，因为仲裁机构在裁决时会考虑公司的行为是否合法合规。

实际操作角度

如果公司因为员工去仲裁就停发工资，员工可以采取以下措施来维护自己的权益：

1. 与公司协商：首先尝试与公司进行协商，要求公司继续支付工资。如果公司拒绝，可以明确告知公司其行为违法，并保留相关证据。
2. 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉公司的违法行为。劳动监察部门有权对公司进行调查，并要求公司支付拖欠的工资。
3. 继续仲裁程序：在仲裁程序中，可以明确提出公司停发工资的行为违法，并要求仲裁机构裁决公司支付拖欠的工资及相应的赔偿。

可能的法律后果

如果公司因为员工去仲裁就停发工资，可能面临以下法律后果：

1. 支付拖欠的工资：公司需要支付员工被拖欠的工资，并可能因此支付额外的赔偿金。
2. 行政处罚：劳动监察部门可能对公司进行行政处罚，包括罚款等。
3. 影响公司信誉：公司的违法行为可能影响其商业信誉，对公司的长期发展不利。

综上所述，公司不能因为员工去仲裁就停发工资。如果公司这样做，员工有权采取法律措施来维护自己的权益。如果你遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细的法律建议和帮助。