早孕请假单位扣工资通常是不合法的。女职工在怀孕期间进行产前检查是其合法权益，用人单位不得因此扣减工资。以下从多个角度对此问题进行详细分析：
法律依据
根据《女职工劳动保护特别规定》第六条，怀孕女职工在劳动时间内进行产前检查，所需时间应计入劳动时间，即该时间视为正常出勤，用人单位应当保障这一权益，并且不能扣减工资。这是国家法律法规对女职工特殊时期的明确保护。
实际操作中可能出现的情况及应对
用人单位知晓且配合：
- 在规范的用人单位中，了解并遵守相关法律法规，会允许女职工在劳动时间内进行产前检查，并正常发放工资。这种情况下，女职工的权益得到了充分保障。
用人单位不知情或故意违法：
- 部分用人单位可能因不了解法律规定或为了降低用工成本，将女职工产检时间当作普通请假处理，扣发相应工资。这种情况下，女职工的合法权益受到了侵害。
女职工如何维护自己的合法权益
提前告知与提供证明：
- 女职工在进行产前检查时，应尽量按照公司规定提前告知用人单位，并提供相关的孕检证明。这样既能确保自己的权益得到保障，也能减少与用人单位的误解和纠纷。
与用人单位协商：
- 如果发现用人单位扣发了产检期间的工资，女职工应首先尝试与用人单位进行沟通，向其说明相关法律规定，要求其补发被扣的工资。这是解决纠纷的第一步，也是最为直接和有效的方式。
寻求外部帮助：
- 如果协商不成，女职工可以向当地的劳动行政部门投诉。劳动行政部门有权责令用人单位限期支付工资差额；逾期不支付的，还可以责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。
- 同时，女职工也可以考虑向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁结果不服的，还可以向人民法院提起诉讼，以法律手段维护自己的合法权益。
总结与建议
综上所述，早孕请假单位扣工资通常是不合法的。女职工在怀孕期间进行产前检查是其合法权益，用人单位应当予以保障并正常发放工资。在实际操作中，女职工应提前告知用人单位并提供相关证明，如遇权益受损，应积极通过协商、投诉、仲裁或诉讼等方式维护自己的合法权益。
如果您在劳动工伤（工资福利）方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。