在法院指定的亲子鉴定机构无法做鉴定的情况下，法院的判决会基于现有证据、法律规定以及公平原则进行综合考虑，具体判决情况可能因案件具体情况而异。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律依据与判决原则

   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十三条，对亲子关系有异议且有正当理由的，父或母（或成年子女）可以向人民法院提起诉讼，请求确认或者否认亲子关系。
   • 判决原则：法院在判决时会尊重当事人意愿，但更会优先考虑未成年人的合法权益。同时，法院会全面审查双方提供的证据，包括出生证明、医疗记录、证人证言等，以形成完整的证据链。若一方拒绝做亲子鉴定，且没有其他直接证据证明亲子关系，法院可能会根据案件具体情况，运用推定原则来判断亲子关系的存在。

2. 具体判决情况

   • 支持重新指定鉴定机构：若法院指定的亲子鉴定机构因技术、设备等原因无法完成鉴定，法院可能会考虑重新指定其他有资质的鉴定机构进行鉴定，以确保鉴定结果的准确性和公正性。
   • 综合考量其他证据：若无法重新指定鉴定机构，或重新指定后仍无法完成鉴定，法院会综合考量双方提供的其他证据。如果其他证据能够形成完整的证据链，足以证明亲子关系的存在与否，法院可能会依据这些证据作出判决。
   • 推定亲子关系：在一方拒绝做亲子鉴定，且没有其他直接证据证明亲子关系的情况下，如果法院根据其他证据和案件具体情况认为亲子关系存在的可能性较大，可能会推定亲子关系的存在，并据此作出相应判决。例如，如果男方自认为孩子的生父并提供了相关证据，而女方无正当理由拒绝做亲子鉴定，法院可能会推定男方与孩子之间存在亲子关系。
   • 驳回诉讼请求：若法院认为现有证据不足以证明亲子关系的存在与否，且无法通过其他方式获取有效证据，法院可能会驳回当事人的诉讼请求，告知其需补充证据后再行起诉。

3. 建议与注意事项

   • 积极配合法院工作：在涉及亲子关系确认的案件中，当事人应积极配合法院的工作，包括提供必要的证据和接受亲子鉴定等。拒绝配合可能会导致法院作出不利于自己的判决。
   • 注重证据收集与保存：当事人应注重收集与保存与亲子关系相关的证据，如出生证明、医疗记录、照片、视频等。这些证据在法院判决时可能起到关键作用。
   • 寻求专业法律帮助：由于亲子关系确认案件涉及复杂的法律问题和证据规则，当事人可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的合法权益得到充分保障。

总结来说，当法院指定的亲子鉴定机构无法做鉴定时，法院的判决会基于现有证据、法律规定以及公平原则进行综合考虑。当事人应积极配合法院工作，注重证据收集与保存，并在必要时寻求专业法律帮助。如果您有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。