关于您提出的小区登记停车位是否合法的问题，这主要取决于停车位的性质、土地性质以及相关的管理规定。以下是对此问题的详细解答：
一、停车位性质决定合法性
产权停车位：
- 如果停车位是产权停车位，即登记在开发商名下，且未在小区房屋销售时按公共建筑面积进行公摊的，那么开发商有权销售此类车位，并可以办理产权证。在这种情况下，小区登记停车位（即开发商销售或出租给业主的停车位）是合法的。
共有停车位：
- 如果停车位是占用业主共有的道路或其他场地（如绿地、活动场所等）用于停放汽车的，那么这些车位属于全体业主共有。对于这类停车位，小区物业或业主委员会可以在征得业主同意后，进行登记管理，但不得擅自出售或出租给非业主使用。因此，在合法合规的前提下，小区登记共有停车位也是合法的。
人防车位：
- 人防车位是依据人防工程所修建的，其产权归国家所有。任何单位及个人均不得对人防区域停车位的所有权进行销售、赠予等。然而，人防工程的使用、收益及管理权由投资者享有。在多数情况下，如果开发商在出售房屋时将人防工程的投资款转嫁到业主身上，且人防工程面积未计入公用建筑面积，那么实际收益管理权益应当归全体业主所有。对于这类车位，小区可以在合法合规的前提下进行登记管理，但不得擅自改变其用途或进行非法交易。
二、土地性质与管理规定
- 在没有规划停车位的老旧小区施划停车位时，需要确定土地性质。如果施划停车位的土地是业主共有的，应当经过业主大会决定，并在施划方案公示征得业主同意后进行。同时，施划停车位不得占用、堵塞、封闭疏散通道、安全出口、消防通道等，不得妨碍其他车辆和行人的正常通行。
- 对于收取管理费的标准，如果物业服务合同有约定的，按照约定执行；政府部门有标准的，按照标准执行；没有约定且政府也没有规定标准的，应当事先征得业主同意。
三、合法合规的登记与管理
- 无论哪种类型的停车位，小区在进行登记管理时都必须遵守相关法律法规和规定，确保合法合规。这包括但不限于：确保停车位的权属清晰、管理权限明确、收费标准合理且透明等。
- 如果小区业主的停车位权利被损害（如共有车位或人防车位被违法售卖或出租），业主可以依据相关法律法规向法院提起诉讼，维护自身合法权益。
综上所述，小区登记停车位在合法合规的前提下是合法的。但具体是否合法还需根据停车位的性质、土地性质以及相关的管理规定来判断。如果您对小区停车位的登记管理有疑问或担忧，建议咨询专业的法律人士或相关机构以获取更准确的解答和建议。