关于“业主车辆进小区登记是否合法”的问题，这实际上涉及到物业管理与业主权益之间的平衡。以下是我对此问题的详细解答：

首先，从物业管理的角度来看，对进出小区的车辆进行登记是一种常见的管理措施。这种登记有助于物业公司了解小区内车辆的情况，包括车辆数量、车主信息等，从而更好地进行小区的安全管理和秩序维护。同时，登记制度也能在一定程度上防止外来车辆随意进入小区，保障小区居民的安全和隐私。

然而，从业主权益的角度来看，业主作为小区的合法居住者，对小区内的公共区域享有共同使用权。这意味着，业主有权自由进出小区，包括驾驶自己的车辆。物业公司无权因业主未缴纳某些费用（如车位管理费）而限制业主车辆进出小区。这种限制行为可能构成对业主物权的妨害，侵犯了业主的合法权益。

在具体实践中，如果物业公司以业主未缴纳车位管理费为由拒绝为业主办理车牌录入手续或限制业主车辆进出小区，业主有权通过法律途径维护自己的权益。根据《民法典》等相关法律法规的规定，业主可以请求法院判令物业公司排除妨害并赔偿经济损失费。

同时，我们也需要注意到，业主与物业公司之间是相互依存的关系。业主按时足额交纳物业费是物业服务人提供更完善更优质物业服务的基础和各项服务开支的来源。而物业服务人不断提升服务水平和服务质量，也能使业主更自觉地交纳物业费，从而形成良性循环。

针对“业主车辆进小区登记”这一具体行为，如果登记制度是为了小区的安全管理和秩序维护而设立的，并且得到了业主的广泛认可和支持，那么这种登记行为就是合法的。但物业公司必须确保登记制度不会侵犯业主的合法权益，如不得因业主未缴纳某些费用而限制业主车辆进出小区。

综上所述，业主车辆进小区登记本身并不违法，但物业公司必须谨慎把握管理边界，确保登记制度不会侵犯业主的合法权益。同时，业主也应按时足额交纳物业费，与物业公司共同维护小区的良好秩序和环境。