关于“日百分之三违约金怎么判”的问题，这主要取决于合同双方的具体约定以及实际损失情况，同时还会受到司法实践中对违约金调整规则的影响。以下是对这一问题的详细解答：

一、违约金约定的基本原则

在大多数民事合同中，违约金的数额或比例是由合同双方当事人根据合同的性质、交易背景及实际损失等多种因素协商确定的。这意味着，日百分之三的违约金比例，如果是在双方自愿、平等、公平的基础上达成的，且没有违反法律法规的强制性规定，那么这一约定在法律上是有效的。

二、司法实践中的调整规则

然而，司法实践中，法院或仲裁机构有权对过高或过低的违约金进行调整。这主要是基于公平原则，防止违约金成为一方不当获利的工具。具体来说：

1. 过高违约金的调整：如果约定的违约金过分高于造成的实际损失，法院或仲裁机构可能会根据当事人的请求，酌情降低违约金数额。一般来说，如果违约金超过造成损失的30%，可能会被认定为“过分高于造成的损失”。因此，日百分之三的违约金，如果在实际损失较低的情况下，可能会被法院或仲裁机构调整。

2. 过低违约金的调整：同样地，如果约定的违约金过分低于造成的实际损失，受损方也有权请求法院或仲裁机构增加违约金数额，以弥补其实际损失。

三、特定领域的法律规定

在某些特定领域，如商品房买卖、金融借款等，法律法规可能对违约金的比例或计算方式有明确规定。如果合同涉及这些领域，且日百分之三的违约金比例与法律法规的规定不符，那么法院或仲裁机构在判决时可能会遵循相关法律法规的规定。

四、建议与注意事项

1. 咨询专业法律人士：在设置或评估违约金条款时，建议咨询专业的法律人士。他们可以根据具体情况提供针对性的法律建议，帮助您制定合法、有效的违约金条款。

2. 仔细阅读合同条款：在签订合同时，务必仔细阅读并理解所有条款，特别是关于违约责任和赔偿方式的约定。这有助于您明确自己的权利和义务，避免未来可能出现的纠纷和风险。

3. 考虑实际损失情况：在约定违约金比例时，应充分考虑实际损失情况。如果违约金比例过高或过低，都可能导致不公平的结果。因此，建议根据合同的履行情况、当事人的过错程度、预期利益以及实际损失等因素来制定合适的违约金条款。

综上所述，日百分之三的违约金怎么判，主要取决于合同双方的具体约定、实际损失情况以及司法实践中的调整规则。在设置或评估违约金条款时，建议咨询专业法律人士并仔细阅读合同条款，以确保条款的合法性和有效性。