工厂搬迁时，员工补偿的工资并非仅指基本工资，而是依据劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资来确定。以下是对这一问题的详细解释：

一、经济补偿的计算依据

根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条的规定，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。这里的“月工资”是一个关键概念，它并非仅指基本工资，而是有明确的法律定义。

二、月工资的定义及计算范围

月工资指的是劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。这一平均工资的计算范围相当广泛，根据《关于工资总额组成的规定》，它包括了计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资以及特殊情况下支付的工资等多个部分。这意味着，在计算经济补偿时，应综合考虑劳动者在这十二个月内的所有收入，以得出其月平均工资作为补偿基数。

三、特殊情况下的经济补偿标准

如果劳动者的月平均工资高于所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，那么经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付。但需要注意的是，这种情况下支付经济补偿的年限最高不超过十二年。这一规定旨在平衡劳动者与用人单位之间的利益，防止过高的经济补偿对用人单位造成过大的负担。

四、工厂搬迁对劳动合同的影响及补偿条件

工厂搬迁可能导致劳动合同履行地发生变更，若因此致使劳动合同无法继续履行且双方未能就变更内容达成一致，用人单位需向员工支付经济补偿。然而，如果工厂搬迁并未对劳动合同履行造成实质性影响，或者员工主动辞职，那么通常不享有经济补偿。此外，如果工厂与员工能就搬迁后的工作安排（如调整工作地点、提供班车接送、发放交通补贴等）达成一致，且员工接受变更后的劳动合同，那么用人单位也无需支付经济补偿。

五、实际操作建议

对于工厂而言，在搬迁前应尽早与员工进行沟通，尝试通过调整工作条件或提供补偿方案等方式达成变更劳动合同的协议，以减少潜在的经济补偿支出。对于员工而言，应了解自己的合法权益，在劳动合同无法继续履行且双方未达成协议时，应及时采取法律手段维护自身权益。

综上所述，工厂搬迁时员工补偿的工资并非仅指基本工资，而是依据劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资来确定。这一规定旨在全面反映劳动者的实际收入水平，确保其在面临合同变更或解除时能够获得合理的经济补偿。如果您在工厂搬迁过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。