离职后公司只发基本工资是否合法，需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：
一、合法性分析
劳动合同与公司规章制度
- 有明确约定：若劳动合同或公司规章制度中明确规定了离职时工资的支付标准，且该标准不违反法律法规的强制性规定，那么公司应当按照约定执行。例如，若合同中明确规定离职时只支付基本工资，且该规定不违反法律，则公司行为合法。
- 无明确约定或约定违法：若劳动合同或规章制度中没有相关规定，或规定与国家法律法规相冲突，公司应遵守法律法规的规定来支付工资。此时，若公司只发放基本工资而未支付其他应得收入（如奖金、津贴等），则可能构成违法。
离职原因与补偿责任
- 员工过错导致离职：若员工因严重违反公司规章制度、失职或被依法追究刑事责任等原因被辞退，且劳动合同或公司规章制度中有明确规定在此类情况下只支付基本工资，该规定不违反法律法规的强制性规定，则公司可以只发放基本工资。
- 非员工过错导致离职：若员工被辞退并非由于其个人过错，如经济裁员或业务调整，公司通常需要支付一定的经济补偿。该补偿应基于员工在公司的服务年限和离职前的月平均工资来计算，月平均工资包括基本工资、绩效工资、奖金、津贴等货币性收入。此时，若公司只发放基本工资，则可能构成违法。
奖金与绩效工资的发放
- 奖金的性质与约定：奖金是用人单位根据自身的经济效益和员工的工作表现，给予员工的一种额外报酬。它并非工资的固定组成部分，而是具有一定的灵活性和激励性。若劳动合同或规章制度中明确规定了奖金的发放条件、标准和方式，且员工在离职前已经满足了这些条件，那么公司应当按照约定发放奖金。
- 绩效工资的发放：绩效工资是根据员工的工作表现和业绩来确定的工资部分。若员工在离职前已经完成了相应的工作任务并达到了绩效标准，那么公司应当支付相应的绩效工资。
二、不合法情况及后果
- 违法辞退：若公司没有合法的事实依据和法律依据随意辞退员工，属于违法解除劳动合同。此时，公司不仅需要按照正常工资标准支付工资，还需按经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
- 未按约定或法定支付：在劳动合同没有特别约定，且离职原因不属于员工过错导致的情况下，公司未按照员工实际的工资构成和应得收入支付工资，只发放基本工资，是不合法的。员工有权要求公司补发差额部分，并可能通过法律途径维护自己的权益。
三、实践建议
对于员工而言：
- 在离职前，应仔细阅读劳动合同和公司规章制度，了解离职时工资的支付标准和条件。
- 若对公司的离职决定或工资支付方案有异议，应及时与公司沟通协商，并保留好相关证据材料。
- 若协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
对于公司而言：
- 应严格遵守法律法规和劳动合同的规定，合理合法地处理员工的离职和工资支付事宜。
- 在制定劳动合同和公司规章制度时，应明确离职时工资的支付标准和条件，以避免引发不必要的法律纠纷。
- 若因特殊情况需要调整工资支付方案，应提前与员工沟通协商，并取得员工的同意。
综上所述，离职后公司只发基本工资是否合法需根据具体情况来判断。在实际操作中，公司和员工都应遵循法律法规和劳动合同的规定，确保双方的权益得到妥善保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。